Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	479578	479598	21	26 [0]	[0] 22	cydB	cytochrome d terminal oxidase, subunit II

CTCACCCGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGA  >  minE/479599‑479669 |                                                                       cTCACCCGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACCACACTgggc  >  1:238848/1‑70 (MQ=255) cTCACCCGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACCACACTggg   >  1:142047/1‑70 (MQ=255) cTCACCCGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACCACACTggg   >  1:64306/1‑70 (MQ=255) cTCACCCGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACCACACTgg    >  1:622357/1‑69 (MQ=255) cTCACCCGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACCACACTgg    >  1:368933/1‑69 (MQ=255) cTCACCCGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGa  >  1:652558/1‑71 (MQ=255) cTCACCCGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGa  >  1:137688/1‑71 (MQ=255) cTCACCCGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGa  >  1:641693/1‑71 (MQ=255) cTCACCCGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGa  >  1:614062/1‑71 (MQ=255) cTCACCCGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGa  >  1:593558/1‑71 (MQ=255) cTCACCCGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGa  >  1:579589/1‑71 (MQ=255) cTCACCCGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGa  >  1:526529/1‑71 (MQ=255) cTCACCCGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGa  >  1:495745/1‑71 (MQ=255) cTCACCCGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGa  >  1:49021/1‑71 (MQ=255) cTCACCCGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGa  >  1:482155/1‑71 (MQ=255) cTCACCCGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGa  >  1:475652/1‑71 (MQ=255) cTCACCCGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGa  >  1:456052/1‑71 (MQ=255) cTCACCCGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGa  >  1:410033/1‑71 (MQ=255) cTCACCCGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGa  >  1:310714/1‑71 (MQ=255) cTCACCCGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGa  >  1:267544/1‑71 (MQ=255) cTCACCCGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGa  >  1:194129/1‑71 (MQ=255) cTCACCCGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGa  >  1:158143/1‑71 (MQ=255) |                                                                       CTCACCCGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGA  >  minE/479599‑479669

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑