Missing coverage evidence...
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GTTCTCTCGGTGAGTTTGGTGCAACCATCACCTTTGTGTCGAACATTCCTGGTGAAACGCGAACCATTCCT  >  minE/502792‑502862 |                                                                       gTTCTCTCTGTGAGTTTGGTGCAACCATCACCTTTGTGTCGAACATTCCTGGTGAAACGCGAACCATTCCt  <  1:527252/71‑1 (MQ=255) gTTCTCTCGGTGAGTTTGGTGCAACCATCACCTTTGTGTCGAACATTCCTGGTGAAACGCGAACCATTCCt  <  1:516220/71‑1 (MQ=255) gTTCTCTCGGTGAGTTTGGTGCAACCATCACCTTTGTGTCGAACATTCCTGGTGAAACGCGAACCATTCCt  <  1:87339/71‑1 (MQ=255) gTTCTCTCGGTGAGTTTGGTGCAACCATCACCTTTGTGTCGAACATTCCTGGTGAAACGCGAACCATTCCt  <  1:87188/71‑1 (MQ=255) gTTCTCTCGGTGAGTTTGGTGCAACCATCACCTTTGTGTCGAACATTCCTGGTGAAACGCGAACCATTCCt  <  1:78798/71‑1 (MQ=255) gTTCTCTCGGTGAGTTTGGTGCAACCATCACCTTTGTGTCGAACATTCCTGGTGAAACGCGAACCATTCCt  <  1:75382/71‑1 (MQ=255) gTTCTCTCGGTGAGTTTGGTGCAACCATCACCTTTGTGTCGAACATTCCTGGTGAAACGCGAACCATTCCt  <  1:648279/71‑1 (MQ=255) gTTCTCTCGGTGAGTTTGGTGCAACCATCACCTTTGTGTCGAACATTCCTGGTGAAACGCGAACCATTCCt  <  1:640832/71‑1 (MQ=255) gTTCTCTCGGTGAGTTTGGTGCAACCATCACCTTTGTGTCGAACATTCCTGGTGAAACGCGAACCATTCCt  <  1:615536/71‑1 (MQ=255) gTTCTCTCGGTGAGTTTGGTGCAACCATCACCTTTGTGTCGAACATTCCTGGTGAAACGCGAACCATTCCt  <  1:61023/71‑1 (MQ=255) gTTCTCTCGGTGAGTTTGGTGCAACCATCACCTTTGTGTCGAACATTCCTGGTGAAACGCGAACCATTCCt  <  1:59419/71‑1 (MQ=255) gTTCTCTCGGTGAGTTTGGTGCAACCATCACCTTTGTGTCGAACATTCCTGGTGAAACGCGAACCATTCCt  <  1:581911/71‑1 (MQ=255) gTTCTCTCGGTGAGTTTGGTGCAACCATCACCTTTGTGTCGAACATTCCTGGTGAAACGCGAACCATTCCt  <  1:570697/71‑1 (MQ=255) gTTCTCTCGGTGAGTTTGGTGCAACCATCACCTTTGTGTCGAACATTCCTGGTGAAACGCGAACCATTCCt  <  1:557600/71‑1 (MQ=255) gTTCTCTCGGTGAGTTTGGTGCAACCATCACCTTTGTGTCGAACATTCCTGGTGAAACGCGAACCATTCCt  <  1:551127/71‑1 (MQ=255) gTTCTCTCGGTGAGTTTGGTGCAACCATCACCTTTGTGTCGAACATTCCTGGTGAAACGCGAACCATTCCt  <  1:101991/71‑1 (MQ=255) gTTCTCTCGGTGAGTTTGGTGCAACCATCACCTTTGTGTCGAACATTCCTGGTGAAACGCGAACCATTCCt  <  1:493612/71‑1 (MQ=255) gTTCTCTCGGTGAGTTTGGTGCAACCATCACCTTTGTGTCGAACATTCCTGGTGAAACGCGAACCATTCCt  <  1:483479/71‑1 (MQ=255) gTTCTCTCGGTGAGTTTGGTGCAACCATCACCTTTGTGTCGAACATTCCTGGTGAAACGCGAACCATTCCt  <  1:457164/71‑1 (MQ=255) gTTCTCTCGGTGAGTTTGGTGCAACCATCACCTTTGTGTCGAACATTCCTGGTGAAACGCGAACCATTCCt  <  1:443239/71‑1 (MQ=255) gTTCTCTCGGTGAGTTTGGTGCAACCATCACCTTTGTGTCGAACATTCCTGGTGAAACGCGAACCATTCCt  <  1:37156/71‑1 (MQ=255) gTTCTCTCGGTGAGTTTGGTGCAACCATCACCTTTGTGTCGAACATTCCTGGTGAAACGCGAACCATTCCt  <  1:233487/71‑1 (MQ=255) gTTCTCTCGGTGAGTTTGGTGCAACCATCACCTTTGTGTCGAACATTCCTGGTGAAACGCGAACCATTCCt  <  1:189864/71‑1 (MQ=255) gTTCTCTCGGTGAGTTTGGTGCAACCATCACCTTTGTGTCGAACATTCCTGGTGAAACGCGAACCATTCCt  <  1:18330/71‑1 (MQ=255) gTTCTCTCGGTGAGTTTGGTGCAACCATCACCTTTGTGTCGAACATTCCTGGTGAAACGCGAACCATTCCt  <  1:173589/71‑1 (MQ=255) gTTCTCTCGGTGAGTTTGGTGCAACCATCACCTTTGTGTCGAACATTCCTGGTGAAACGCGAACCATTCCt  <  1:170791/71‑1 (MQ=255) gTTCTCTCGGTGAGTTTGGTGCAACCATCACCTTTGTGTCGAACATTCCTGGTGAAACGCGAACCATTCCt  <  1:154302/71‑1 (MQ=255) gTTCTCTCGGTGAGTTTGGTGCAACCATCACCTTTGTGTCGAACATTCCTGGTGAAACGCGAACCATTCCt  <  1:116490/71‑1 (MQ=255) gTTCTCTCGGTGAGTTTGGTGCAACCATCACCTTAGTGTCGAACATTCCTGGTGAAACGCGAACCATTCCt  <  1:264074/71‑1 (MQ=255) |                                                                       GTTCTCTCGGTGAGTTTGGTGCAACCATCACCTTTGTGTCGAACATTCCTGGTGAAACGCGAACCATTCCT  >  minE/502792‑502862

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑