Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	560742	560783	42	17 [0]	[0] 52	ybjI	conserved hypothetical protein

CTCTAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAT  >  minE/560784‑560854 |                                                                       ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTcc                     >  1:495719/1‑52 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCa   >  1:71083/1‑70 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCa   >  1:644651/1‑70 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCa   >  1:633541/1‑70 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCa   >  1:626131/1‑70 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCa   >  1:214477/1‑70 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:589897/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:445385/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:456212/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:460789/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:478519/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:482912/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:490852/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:512769/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:534026/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:561713/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:562373/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:569761/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:384749/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:624912/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:62703/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:636036/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:67599/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:77624/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:8141/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:84149/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:2419/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:117124/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:129703/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:137121/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:142093/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:144371/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:163388/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:166566/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:1731/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:185184/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:191196/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:207868/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:236529/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:10630/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:25196/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:262744/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:267688/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:313227/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:322852/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:335820/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:348471/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:348499/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:371387/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAt  >  1:379635/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTACATGGCAt  >  1:395552/1‑71 (MQ=255) ctctAAGTTGTCAAAGTAATCGACGTATTCCAGACGGTGATAAAAc                           >  1:35458/1‑46 (MQ=38) |                                                                       CTCTAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCAT  >  minE/560784‑560854

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑