Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	824442	824685	244	45 [0]	[0] 40	chaC	regulatory protein for cation transport

CGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGTTTT  >  minE/824686‑824756 |                                                                       cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:57784/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:459522/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:484025/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:499090/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:529447/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:532847/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:54007/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:558531/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:559048/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:563423/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:459521/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:587533/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:616573/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:633778/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:64279/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:649894/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:654290/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:75577/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:80200/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:86268/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:303542/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:177676/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:182684/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:212985/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:213119/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:228933/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:238863/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:252209/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:258645/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:295004/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:173551/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:335134/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:336950/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:355113/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:380873/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:419168/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:422502/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:422830/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:439311/71‑1 (MQ=255) cgcTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGtttt  <  1:454458/71‑1 (MQ=255) |                                                                       CGCTCAGGTCATCGCGCCGTTGATTGCGGCGGCGAGCGGTCCGCTGGGAACCAACGCACAATACCTGTTTT  >  minE/824686‑824756

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑