Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 826293 826333 41 7 [0] [0] 55 ychP predicted invasin

AACAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCT  >  minE/826334‑826403
|                                                                     
aaCAGGGTGAAAGTGTCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:416706/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTc                                     >  1:647710/1‑35 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCgg                                   >  1:521372/1‑37 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCg                                    >  1:524182/1‑36 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAAtt                     >  1:462642/1‑51 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACctct  >  1:618914/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCg    >  1:651151/1‑68 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCg    >  1:295038/1‑68 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGc   >  1:107964/1‑69 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGc   >  1:194497/1‑69 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:567173/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:460106/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:161781/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:463270/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:495828/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:518848/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:520439/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:157074/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:530074/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:546335/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:562289/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:562824/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:457531/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:594459/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:604264/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:12851/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:626170/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:634807/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:124632/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:649203/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:105639/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:76125/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:333520/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:226322/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:234592/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:235567/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:235904/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:255827/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:256089/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:273194/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:27543/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:276548/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:305325/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:306871/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:217297/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:356922/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:370863/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:402429/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:413831/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:183301/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:418423/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:428989/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:432833/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:437645/1‑70 (MQ=255)
aaCAGGCTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCt  >  1:1356/1‑70 (MQ=255)
|                                                                     
AACAGGGTGAAAGTGGCGAAAATCAAAATAACCTCGGGCTGAATCTTAATTACCGCTTTGGTGTACCGCT  >  minE/826334‑826403

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: