Missing coverage evidence...
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GGCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCG  >  minE/879710‑879780 |                                                                       ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:54041/71‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:416700/71‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:444213/71‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:444980/71‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:461342/71‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:478121/71‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:517863/71‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:525078/71‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:527366/71‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:409018/71‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:545479/71‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:553509/71‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:55957/71‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:592888/71‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:626053/71‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:635185/71‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:660461/71‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:660863/71‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:315576/71‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:109919/71‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:122874/71‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:127230/71‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:132414/71‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:14335/71‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:168827/71‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:2866/71‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:308042/71‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:105881/71‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:326671/71‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:351751/71‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:366763/71‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:377944/71‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:389182/71‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:39150/71‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:391660/71‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCg  <  1:407668/71‑1 (MQ=255) |                                                                       GGCACCGTTGAAGCCCACCTTACGCTCGGAAACCTGTTCCGTTCGCGTGGCGAAGTTGATCGCGCTATTCG  >  minE/879710‑879780

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑