Missing coverage evidence...
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GAGAATTGCCATCGACAGTGCGCGGGTGATCTCGGTGACCAGCCCGGCGGTGATGTTTGGCATCACAGCA  >  minE/892786‑892855 |                                                                      gagaATTGCCATGGACAGTGCGCGGGTGATCTCGGTGACCAGCCCGGCGGTGATGTTTGGCATCACAGc   >  1:592050/1‑69 (MQ=255) gagaATTGCCATCGACAGTGGGCGGGTGATCTCGGTGACCAGCCCGGCGGTGATGTTTGGCATCACAGCa  >  1:75363/1‑70 (MQ=255) gagaATTGCCATCGACAGTGCGCGGGTGATCTCGGTGACCAGCCCGGCGGTGATGTTTGGCATCACAgaa  >  1:609092/1‑68 (MQ=255) gagaATTGCCATCGACAGTGCGCGGGTGATCTCGGTGACCAGCCCGGCGGTGATGTTTGGCATCACAg    >  1:523481/1‑68 (MQ=255) gagaATTGCCATCGACAGTGCGCGGGTGATCTCGGTGACCAGCCCGGCGGTGATGTTTGGCATCACAGc   >  1:67141/1‑69 (MQ=255) gagaATTGCCATCGACAGTGCGCGGGTGATCTCGGTGACCAGCCCGGCGGTGATGTTTGGCATCACAGc   >  1:534031/1‑69 (MQ=255) gagaATTGCCATCGACAGTGCGCGGGTGATCTCGGTGACCAGCCCGGCGGTGATGTTTGGCATCACAGc   >  1:263575/1‑69 (MQ=255) gagaATTGCCATCGACAGTGCGCGGGTGATCTCGGTGACCAGCCCGGCGGTGATGTTTGGCATCACAGc   >  1:243433/1‑69 (MQ=255) 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|                                                                      GAGAATTGCCATCGACAGTGCGCGGGTGATCTCGGTGACCAGCCCGGCGGTGATGTTTGGCATCACAGCA  >  minE/892786‑892855

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑