Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1039033	1039054	22	8 [0]	[1] 58	rsxE	predicted inner membrane NADH‑quinone reductase

GAGATTTTCCACACCGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGAA  >  minE/1039041‑1039125               |                                                                       gagaTTTTCCACACCGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTa                             >  1:624590/1‑58 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:53527/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:408092/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:415053/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:423966/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:431184/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:432461/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:44343/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:451147/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:451713/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:477253/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:483441/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:485313/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:501741/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:505142/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:526024/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:403273/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:548914/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:556306/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:561298/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:583324/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:584096/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:586761/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:601173/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:602621/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:625727/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:659974/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:67768/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:71192/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:251008/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:143182/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:144635/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:152807/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:164139/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:164292/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:16694/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:199018/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:200628/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:205857/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:213410/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:217906/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:23028/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:231855/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:243060/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:130729/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:257691/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:263439/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:276707/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:278288/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:292618/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:293365/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:298291/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:31641/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:325836/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:338832/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:344119/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:370243/71‑1 (MQ=255)               cGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGaa  <  1:390698/71‑1 (MQ=255)               |                                                                       GAGATTTTCCACACCGACTCCCCTTTCCTGCTGGCGATGCTGCCACCAGGTGCATTTATTGGCCTGGGACTGATGCTGGCAGGAA  >  minE/1039041‑1039125

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑