Missing coverage evidence...
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TTTCAGAGATACCGGGATCGGCCAACTCAAACTTGCCAGCTGTGCGACCCGGTGTTCATCAATTGTCGCC  >  minE/1047159‑1047228 |                                                                      tttCAGAGATACCGGGATCGGCGAACTCAAACTTGCCAGCTGTGCGACCCGGTGTTCATCAATTGTCGcc  <  1:365947/70‑1 (MQ=255) tttCAGAGATACCGGGATCGGCCAACTCAAACTTGCCAGCTGTGCGACCCGGTGTTCATCAATTGTCGcc  <  1:104911/70‑1 (MQ=255) tttCAGAGATACCGGGATCGGCCAACTCAAACTTGCCAGCTGTGCGACCCGGTGTTCATCAATTGTCGcc  <  1:650424/70‑1 (MQ=255) tttCAGAGATACCGGGATCGGCCAACTCAAACTTGCCAGCTGTGCGACCCGGTGTTCATCAATTGTCGcc  <  1:569010/70‑1 (MQ=255) tttCAGAGATACCGGGATCGGCCAACTCAAACTTGCCAGCTGTGCGACCCGGTGTTCATCAATTGTCGcc  <  1:527438/70‑1 (MQ=255) tttCAGAGATACCGGGATCGGCCAACTCAAACTTGCCAGCTGTGCGACCCGGTGTTCATCAATTGTCGcc  <  1:526619/70‑1 (MQ=255) tttCAGAGATACCGGGATCGGCCAACTCAAACTTGCCAGCTGTGCGACCCGGTGTTCATCAATTGTCGcc  <  1:513092/70‑1 (MQ=255) tttCAGAGATACCGGGATCGGCCAACTCAAACTTGCCAGCTGTGCGACCCGGTGTTCATCAATTGTCGcc  <  1:496923/70‑1 (MQ=255) tttCAGAGATACCGGGATCGGCCAACTCAAACTTGCCAGCTGTGCGACCCGGTGTTCATCAATTGTCGcc  <  1:480175/70‑1 (MQ=255) tttCAGAGATACCGGGATCGGCCAACTCAAACTTGCCAGCTGTGCGACCCGGTGTTCATCAATTGTCGcc  <  1:48011/70‑1 (MQ=255) tttCAGAGATACCGGGATCGGCCAACTCAAACTTGCCAGCTGTGCGACCCGGTGTTCATCAATTGTCGcc  <  1:474670/70‑1 (MQ=255) tttCAGAGATACCGGGATCGGCCAACTCAAACTTGCCAGCTGTGCGACCCGGTGTTCATCAATTGTCGcc  <  1:451633/70‑1 (MQ=255) tttCAGAGATACCGGGATCGGCCAACTCAAACTTGCCAGCTGTGCGACCCGGTGTTCATCAATTGTCGcc  <  1:450644/70‑1 (MQ=255) tttCAGAGATACCGGGATCGGCCAACTCAAACTTGCCAGCTGTGCGACCCGGTGTTCATCAATTGTCGcc  <  1:448693/70‑1 (MQ=255) tttCAGAGATACCGGGATCGGCCAACTCAAACTTGCCAGCTGTGCGACCCGGTGTTCATCAATTGTCGcc  <  1:430048/70‑1 (MQ=255) tttCAGAGATACCGGGATCGGCCAACTCAAACTTGCCAGCTGTGCGACCCGGTGTTCATCAATTGTCGcc  <  1:384394/70‑1 (MQ=255) tttCAGAGATACCGGGATCGGCCAACTCAAACTTGCCAGCTGTGCGACCCGGTGTTCATCAATTGTCGcc  <  1:381037/70‑1 (MQ=255) tttCAGAGATACCGGGATCGGCCAACTCAAACTTGCCAGCTGTGCGACCCGGTGTTCATCAATTGTCGcc  <  1:328280/70‑1 (MQ=255) tttCAGAGATACCGGGATCGGCCAACTCAAACTTGCCAGCTGTGCGACCCGGTGTTCATCAATTGTCGcc  <  1:267727/70‑1 (MQ=255) tttCAGAGATACCGGGATCGGCCAACTCAAACTTGCCAGCTGTGCGACCCGGTGTTCATCAATTGTCGcc  <  1:216002/70‑1 (MQ=255) tttCAGAGATACCGGGATCGGCCAACTCAAACTTGCCAGCTGTGCGACCCGGTGTTCATCAATTGTCGcc  <  1:212866/70‑1 (MQ=255) tttCAGAGATACCGGGATCGGCCAACTCAAACTTGCCAGCTGTGCGACCCGGTGTTCATCAATTGTCGcc  <  1:206268/70‑1 (MQ=255) tttCAGAGATACCGGGATCGGCCAACTCAAACTTGCCAGCTGTGCGACCCGGTGTTCATCAATTGTCGcc  <  1:162950/70‑1 (MQ=255) tttCAGAGATACCGGGATCGGCCAACTCAAACTTGCCAGCTGTGCGACCCGGTGTTCATCAATTGTCGcc  <  1:162645/70‑1 (MQ=255) tttCAGAGATACCGGGATCGGCCAACTCAAACTTGCCAGCTGTGCGACCCGGTGTTCATCAATTGTCGcc  <  1:158433/70‑1 (MQ=255) tttCAGAGATACCGGGATCGGCCAACTCAAACTTGCCAGCTGTGCGACCCGGTGTTCATCAATTGTCGcc  <  1:155627/70‑1 (MQ=255) tttCAGAGATACCGGGATCGGCCAACTCAAACTTGCCAGCTGTGCGACCCGGTGTTCATCAATTGTCGcc  <  1:146572/70‑1 (MQ=255) tttCAGAGATACCGGGATCGGCCAACTCAAACTTGCCAGCTGTGCGACCCGGTGTTCATCAATTGTCGcc  <  1:118028/70‑1 (MQ=255) tttCAGAGATACCGGGATCGGCCAACTCAAACTTGCCAGCTGTGCGACCCGGTGTTCATCAATTGTCGcc  <  1:111114/70‑1 (MQ=255) tttCAGAGATACCGGGATCGGCCAACTCAAACTTGCCAGCTGTGCGACCCGGTGTTCATCAATTGTCGcc  <  1:10173/70‑1 (MQ=255) tttCAGAGATACCGGGATCGGCCAACTCAAACTTGCCAGCTGTGCGACCCGGTGTTCATCAATAGTCGcc  <  1:84461/70‑1 (MQ=255) |                                                                      TTTCAGAGATACCGGGATCGGCCAACTCAAACTTGCCAGCTGTGCGACCCGGTGTTCATCAATTGTCGCC  >  minE/1047159‑1047228

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑