Missing coverage evidence...
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GCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGT  >  minE/1053483‑1053550 |                                                                    gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGcc                      >  1:368061/1‑48 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGc                       >  1:224058/1‑47 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAACACCcgc        >  1:37559/1‑62 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGt  >  1:427163/1‑68 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGt  >  1:340618/1‑68 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGt  >  1:354560/1‑68 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGt  >  1:365429/1‑68 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGt  >  1:367799/1‑68 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGt  >  1:395789/1‑68 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGt  >  1:414955/1‑68 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGt  >  1:273289/1‑68 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGt  >  1:429090/1‑68 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGt  >  1:441004/1‑68 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGt  >  1:451567/1‑68 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGt  >  1:475643/1‑68 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGt  >  1:485515/1‑68 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGt  >  1:500200/1‑68 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGt  >  1:657518/1‑68 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGt  >  1:93835/1‑68 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGt  >  1:210792/1‑68 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGt  >  1:107970/1‑68 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGt  >  1:121384/1‑68 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGt  >  1:129464/1‑68 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGt  >  1:136696/1‑68 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGt  >  1:15116/1‑68 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGt  >  1:175739/1‑68 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGt  >  1:177774/1‑68 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGt  >  1:204554/1‑68 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGt  >  1:298008/1‑68 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGt  >  1:213074/1‑68 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGt  >  1:23588/1‑68 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGt  >  1:235972/1‑68 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGt  >  1:238591/1‑68 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGt  >  1:239037/1‑68 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGt  >  1:240591/1‑68 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGt  >  1:267010/1‑68 (MQ=255) gCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGt  >  1:107906/1‑68 (MQ=255) |                                                                    GCTCATTTTATTCCAGTTAAAACGCTCATCACGACTACGAAAACAGCCGCGACAAAACCCGCGTTCGT  >  minE/1053483‑1053550

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑