Missing coverage evidence...
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GCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGCC  >  minE/1088935‑1089005 |                                                                       gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGtt                       >  1:496683/1‑50 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCGCCTCTTCACCTGCCACGcc  >  1:46794/1‑71 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGcc  >  1:552707/1‑71 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGcc  >  1:46856/1‑71 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGcc  >  1:503412/1‑71 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGcc  >  1:510388/1‑71 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGcc  >  1:51677/1‑71 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGcc  >  1:521271/1‑71 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGcc  >  1:533184/1‑71 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGcc  >  1:453350/1‑71 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGcc  >  1:560598/1‑71 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGcc  >  1:573092/1‑71 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGcc  >  1:581357/1‑71 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGcc  >  1:583664/1‑71 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGcc  >  1:589754/1‑71 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGcc  >  1:637554/1‑71 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGcc  >  1:82931/1‑71 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGcc  >  1:99953/1‑71 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGcc  >  1:289135/1‑71 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGcc  >  1:113650/1‑71 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGcc  >  1:125535/1‑71 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGcc  >  1:149046/1‑71 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGcc  >  1:15706/1‑71 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGcc  >  1:170005/1‑71 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGcc  >  1:178935/1‑71 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGcc  >  1:233841/1‑71 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGcc  >  1:105172/1‑71 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGcc  >  1:308157/1‑71 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGcc  >  1:359624/1‑71 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGcc  >  1:392337/1‑71 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGcc  >  1:407027/1‑71 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGcc  >  1:427315/1‑71 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGcc  >  1:441297/1‑71 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGcc  >  1:452685/1‑71 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGc   >  1:526493/1‑70 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGc   >  1:179922/1‑70 (MQ=255) gCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGc   >  1:166706/1‑70 (MQ=255) |                                                                       GCTTCGGCACCTTCCGCCAGATCCAGATGATGTCGGTAATGGGCAGTGTTCACCTCTTCACCTGCCACGCC  >  minE/1088935‑1089005

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑