Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1164298	1164385	88	36 [0]	[0] 35	ynjB	conserved hypothetical protein

CCGCCGCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCTT  >  minE/1164386‑1164456 |                                                                       ccgccgCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCtt  <  1:561884/71‑1 (MQ=255) ccgccgCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCtt  <  1:442830/71‑1 (MQ=255) ccgccgCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCtt  <  1:456224/71‑1 (MQ=255) ccgccgCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCtt  <  1:469547/71‑1 (MQ=255) ccgccgCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCtt  <  1:490034/71‑1 (MQ=255) ccgccgCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCtt  <  1:496892/71‑1 (MQ=255) ccgccgCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCtt  <  1:500322/71‑1 (MQ=255) ccgccgCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCtt  <  1:508739/71‑1 (MQ=255) ccgccgCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCtt  <  1:538496/71‑1 (MQ=255) ccgccgCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCtt  <  1:426203/71‑1 (MQ=255) ccgccgCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCtt  <  1:575890/71‑1 (MQ=255) ccgccgCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCtt  <  1:580503/71‑1 (MQ=255) ccgccgCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCtt  <  1:601924/71‑1 (MQ=255) ccgccgCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCtt  <  1:626734/71‑1 (MQ=255) ccgccgCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCtt  <  1:628254/71‑1 (MQ=255) ccgccgCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCtt  <  1:64610/71‑1 (MQ=255) ccgccgCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCtt  <  1:658025/71‑1 (MQ=255) ccgccgCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCtt  <  1:93168/71‑1 (MQ=255) ccgccgCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCtt  <  1:271043/71‑1 (MQ=255) ccgccgCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCtt  <  1:144368/71‑1 (MQ=255) ccgccgCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCtt  <  1:174254/71‑1 (MQ=255) ccgccgCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCtt  <  1:191787/71‑1 (MQ=255) ccgccgCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCtt  <  1:215882/71‑1 (MQ=255) ccgccgCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCtt  <  1:233811/71‑1 (MQ=255) ccgccgCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCtt  <  1:239257/71‑1 (MQ=255) ccgccgCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCtt  <  1:256806/71‑1 (MQ=255) ccgccgCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCtt  <  1:270270/71‑1 (MQ=255) ccgccgCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCtt  <  1:103337/71‑1 (MQ=255) ccgccgCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCtt  <  1:297186/71‑1 (MQ=255) ccgccgCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCtt  <  1:305662/71‑1 (MQ=255) ccgccgCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCtt  <  1:325289/71‑1 (MQ=255) ccgccgCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCtt  <  1:395185/71‑1 (MQ=255) ccgccgCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCtt  <  1:401611/71‑1 (MQ=255) ccgccgCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCtt  <  1:413097/71‑1 (MQ=255) ccgccgCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCtt  <  1:418110/71‑1 (MQ=255) |                                                                       CCGCCGCATTAAAAGAAGCGCCGGACGATGCGACTTTCGCCCGTGTCACTGCTCCCTTGTGGCAATATCTT  >  minE/1164386‑1164456

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑