Missing coverage evidence...
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GAGAAAACCGACAATTTTATCCTGCTCACGGCAACCGAATGCTTCACGCACTACCGGACTTTCAGTTAATG  >  minE/1175894‑1175964 |                                                                       gagaACACCGACAATTTTATCCTGCTCACGGCAACCGAATGCTTCACGCACTACCGGACTTTCAGTTAATg  >  1:141134/1‑71 (MQ=255) gagaAAACCGACAATTTTATCCTGCTCACGGCAACCGAATGCTTCACGCACTACCGGACTTTCAGTTAAt   >  1:448338/1‑70 (MQ=255) gagaAAACCGACAATTTTATCCTGCTCACGGCAACCGAATGCTTCACGCACTACCGGACTTTCAGTTAATg  >  1:390676/1‑71 (MQ=255) gagaAAACCGACAATTTTATCCTGCTCACGGCAACCGAATGCTTCACGCACTACCGGACTTTCAGTTAATg  >  1:93034/1‑71 (MQ=255) gagaAAACCGACAATTTTATCCTGCTCACGGCAACCGAATGCTTCACGCACTACCGGACTTTCAGTTAATg  >  1:90051/1‑71 (MQ=255) gagaAAACCGACAATTTTATCCTGCTCACGGCAACCGAATGCTTCACGCACTACCGGACTTTCAGTTAATg  >  1:85303/1‑71 (MQ=255) gagaAAACCGACAATTTTATCCTGCTCACGGCAACCGAATGCTTCACGCACTACCGGACTTTCAGTTAATg  >  1:640888/1‑71 (MQ=255) gagaAAACCGACAATTTTATCCTGCTCACGGCAACCGAATGCTTCACGCACTACCGGACTTTCAGTTAATg  >  1:624863/1‑71 (MQ=255) gagaAAACCGACAATTTTATCCTGCTCACGGCAACCGAATGCTTCACGCACTACCGGACTTTCAGTTAATg  >  1:574377/1‑71 (MQ=255) gagaAAACCGACAATTTTATCCTGCTCACGGCAACCGAATGCTTCACGCACTACCGGACTTTCAGTTAATg  >  1:569765/1‑71 (MQ=255) gagaAAACCGACAATTTTATCCTGCTCACGGCAACCGAATGCTTCACGCACTACCGGACTTTCAGTTAATg  >  1:558205/1‑71 (MQ=255) gagaAAACCGACAATTTTATCCTGCTCACGGCAACCGAATGCTTCACGCACTACCGGACTTTCAGTTAATg  >  1:513932/1‑71 (MQ=255) gagaAAACCGACAATTTTATCCTGCTCACGGCAACCGAATGCTTCACGCACTACCGGACTTTCAGTTAATg  >  1:513402/1‑71 (MQ=255) gagaAAACCGACAATTTTATCCTGCTCACGGCAACCGAATGCTTCACGCACTACCGGACTTTCAGTTAATg  >  1:460292/1‑71 (MQ=255) gagaAAACCGACAATTTTATCCTGCTCACGGCAACCGAATGCTTCACGCACTACCGGACTTTCAGTTAATg  >  1:421039/1‑71 (MQ=255) gagaAAACCGACAATTTTATCCTGCTCACGGCAACCGAATGCTTCACGCACTACCGGACTTTCAGTTAATg  >  1:371243/1‑71 (MQ=255) gagaAAACCGACAATTTTATCCTGCTCACGGCAACCGAATGCTTCACGCACTACCGGACTTTCAGTTAATg  >  1:368671/1‑71 (MQ=255) gagaAAACCGACAATTTTATCCTGCTCACGGCAACCGAATGCTTCACGCACTACCGGACTTTCAGTTAATg  >  1:358245/1‑71 (MQ=255) gagaAAACCGACAATTTTATCCTGCTCACGGCAACCGAATGCTTCACGCACTACCGGACTTTCAGTTAATg  >  1:340154/1‑71 (MQ=255) gagaAAACCGACAATTTTATCCTGCTCACGGCAACCGAATGCTTCACGCACTACCGGACTTTCAGTTAATg  >  1:327974/1‑71 (MQ=255) gagaAAACCGACAATTTTATCCTGCTCACGGCAACCGAATGCTTCACGCACTACCGGACTTTCAGTTAATg  >  1:315339/1‑71 (MQ=255) gagaAAACCGACAATTTTATCCTGCTCACGGCAACCGAATGCTTCACGCACTACCGGACTTTCAGTTAATg  >  1:231287/1‑71 (MQ=255) gagaAAACCGACAATTTTATCCTGCTCACGGCAACCGAATGCTTCACGCACTACCGGACTTTCAGTTAATg  >  1:216201/1‑71 (MQ=255) gagaAAACCGACAATTTTATCCTGCTCACGGCAACCGAATGCTTCACGCACTACCGGACTTTCAGTTAATg  >  1:207248/1‑71 (MQ=255) gagaAAACCGACAATTTTATCCTGCTCACGGCAACCGAATGCTTCACGCACTACCGGACTTTCAGTTAATg  >  1:19765/1‑71 (MQ=255) gagaAAACCGACAATTTTATCCTGCTCACGGCAACCGAATGCTTCACGCACTACCGGACTTTCAGTTAATg  >  1:173526/1‑71 (MQ=255) gagaAAACCGACAATTTTATCCTGCTCACGGCAACCGAATGCTTCACGCACTACCGGACTTTCAGTTAATg  >  1:170520/1‑71 (MQ=255) |                                                                       GAGAAAACCGACAATTTTATCCTGCTCACGGCAACCGAATGCTTCACGCACTACCGGACTTTCAGTTAATG  >  minE/1175894‑1175964

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑