Missing coverage evidence...
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ATTACGTGACTGATTCTAACAAAACATTAACACCAACTGGCAAAATTTTGTCCTAAACTTGATCTCGACGA  >  minE/1179588‑1179658 |                                                                       aTTACGTGACTGATTCTAACAAAACATTAACACCAACTGGCAAAATTTTGTCCTAAACTTGATCTcgacga  <  1:40845/71‑1 (MQ=255) aTTACGTGACTGATTCTAACAAAACATTAACACCAACTGGCAAAATTTTGTCCTAAACTTGATCTcgacga  <  1:78030/71‑1 (MQ=255) aTTACGTGACTGATTCTAACAAAACATTAACACCAACTGGCAAAATTTTGTCCTAAACTTGATCTcgacga  <  1:639523/71‑1 (MQ=255) aTTACGTGACTGATTCTAACAAAACATTAACACCAACTGGCAAAATTTTGTCCTAAACTTGATCTcgacga  <  1:630657/71‑1 (MQ=255) aTTACGTGACTGATTCTAACAAAACATTAACACCAACTGGCAAAATTTTGTCCTAAACTTGATCTcgacga  <  1:624005/71‑1 (MQ=255) aTTACGTGACTGATTCTAACAAAACATTAACACCAACTGGCAAAATTTTGTCCTAAACTTGATCTcgacga  <  1:615875/71‑1 (MQ=255) aTTACGTGACTGATTCTAACAAAACATTAACACCAACTGGCAAAATTTTGTCCTAAACTTGATCTcgacga  <  1:579784/71‑1 (MQ=255) aTTACGTGACTGATTCTAACAAAACATTAACACCAACTGGCAAAATTTTGTCCTAAACTTGATCTcgacga  <  1:541414/71‑1 (MQ=255) aTTACGTGACTGATTCTAACAAAACATTAACACCAACTGGCAAAATTTTGTCCTAAACTTGATCTcgacga  <  1:422010/71‑1 (MQ=255) aTTACGTGACTGATTCTAACAAAACATTAACACCAACTGGCAAAATTTTGTCCTAAACTTGATCTcgacga  <  1:416460/71‑1 (MQ=255) aTTACGTGACTGATTCTAACAAAACATTAACACCAACTGGCAAAATTTTGTCCTAAACTTGATCTcgacga  <  1:112388/71‑1 (MQ=255) aTTACGTGACTGATTCTAACAAAACATTAACACCAACTGGCAAAATTTTGTCCTAAACTTGATCTcgacga  <  1:391273/71‑1 (MQ=255) aTTACGTGACTGATTCTAACAAAACATTAACACCAACTGGCAAAATTTTGTCCTAAACTTGATCTcgacga  <  1:359402/71‑1 (MQ=255) aTTACGTGACTGATTCTAACAAAACATTAACACCAACTGGCAAAATTTTGTCCTAAACTTGATCTcgacga  <  1:322166/71‑1 (MQ=255) aTTACGTGACTGATTCTAACAAAACATTAACACCAACTGGCAAAATTTTGTCCTAAACTTGATCTcgacga  <  1:31267/71‑1 (MQ=255) aTTACGTGACTGATTCTAACAAAACATTAACACCAACTGGCAAAATTTTGTCCTAAACTTGATCTcgacga  <  1:301335/71‑1 (MQ=255) aTTACGTGACTGATTCTAACAAAACATTAACACCAACTGGCAAAATTTTGTCCTAAACTTGATCTcgacga  <  1:289602/71‑1 (MQ=255) aTTACGTGACTGATTCTAACAAAACATTAACACCAACTGGCAAAATTTTGTCCTAAACTTGATCTcgacga  <  1:269407/71‑1 (MQ=255) aTTACGTGACTGATTCTAACAAAACATTAACACCAACTGGCAAAATTTTGTCCTAAACTTGATCTcgacga  <  1:235938/71‑1 (MQ=255) |                                                                       ATTACGTGACTGATTCTAACAAAACATTAACACCAACTGGCAAAATTTTGTCCTAAACTTGATCTCGACGA  >  minE/1179588‑1179658

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑