Missing coverage evidence...
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TCTTGATCTGCTCTTTGAAGATTTGGCCTTACCGAATCTGAAACAAAACCAACAACGCCAGCTGACCGAA  >  minE/1186454‑1186523 |                                                                      tCTTGATCTGCTCTTTGAAGATTTGGCCTTACCGAATCTGAAACAAAACCAACAACGCCAGCTGACCGaa  >  1:440203/1‑70 (MQ=255) tCTTGATCTGCTCTTTGAAGATTTGGCCTTACCGAATCTGAAACAAAACCAACAACGCCAGCTGACCGaa  >  1:634224/1‑70 (MQ=255) tCTTGATCTGCTCTTTGAAGATTTGGCCTTACCGAATCTGAAACAAAACCAACAACGCCAGCTGACCGaa  >  1:620853/1‑70 (MQ=255) tCTTGATCTGCTCTTTGAAGATTTGGCCTTACCGAATCTGAAACAAAACCAACAACGCCAGCTGACCGaa  >  1:593396/1‑70 (MQ=255) tCTTGATCTGCTCTTTGAAGATTTGGCCTTACCGAATCTGAAACAAAACCAACAACGCCAGCTGACCGaa  >  1:578799/1‑70 (MQ=255) tCTTGATCTGCTCTTTGAAGATTTGGCCTTACCGAATCTGAAACAAAACCAACAACGCCAGCTGACCGaa  >  1:578009/1‑70 (MQ=255) tCTTGATCTGCTCTTTGAAGATTTGGCCTTACCGAATCTGAAACAAAACCAACAACGCCAGCTGACCGaa  >  1:571277/1‑70 (MQ=255) tCTTGATCTGCTCTTTGAAGATTTGGCCTTACCGAATCTGAAACAAAACCAACAACGCCAGCTGACCGaa  >  1:48592/1‑70 (MQ=255) tCTTGATCTGCTCTTTGAAGATTTGGCCTTACCGAATCTGAAACAAAACCAACAACGCCAGCTGACCGaa  >  1:474348/1‑70 (MQ=255) tCTTGATCTGCTCTTTGAAGATTTGGCCTTACCGAATCTGAAACAAAACCAACAACGCCAGCTGACCGaa  >  1:460882/1‑70 (MQ=255) tCTTGATCTGCTCTTTGAAGATTTGGCCTTACCGAATCTGAAACAAAACCAACAACGCCAGCTGACCGaa  >  1:459063/1‑70 (MQ=255) tCTTGATCTGCTCTTTGAAGATTTGGCCTTACCGAATCTGAAACAAAACCAACAACGCCAGCTGACCGaa  >  1:458821/1‑70 (MQ=255) tCTTGATCTGCTCTTTGAAGATTTGGCCTTACCGAATCTGAAACAAAACCAACAACGCCAGCTGACCGaa  >  1:448647/1‑70 (MQ=255) tCTTGATCTGCTCTTTGAAGATTTGGCCTTACCGAATCTGAAACAAAACCAACAACGCCAGCTGACCGaa  >  1:109500/1‑70 (MQ=255) tCTTGATCTGCTCTTTGAAGATTTGGCCTTACCGAATCTGAAACAAAACCAACAACGCCAGCTGACCGaa  >  1:397402/1‑70 (MQ=255) tCTTGATCTGCTCTTTGAAGATTTGGCCTTACCGAATCTGAAACAAAACCAACAACGCCAGCTGACCGaa  >  1:392871/1‑70 (MQ=255) tCTTGATCTGCTCTTTGAAGATTTGGCCTTACCGAATCTGAAACAAAACCAACAACGCCAGCTGACCGaa  >  1:375986/1‑70 (MQ=255) tCTTGATCTGCTCTTTGAAGATTTGGCCTTACCGAATCTGAAACAAAACCAACAACGCCAGCTGACCGaa  >  1:373563/1‑70 (MQ=255) tCTTGATCTGCTCTTTGAAGATTTGGCCTTACCGAATCTGAAACAAAACCAACAACGCCAGCTGACCGaa  >  1:361912/1‑70 (MQ=255) tCTTGATCTGCTCTTTGAAGATTTGGCCTTACCGAATCTGAAACAAAACCAACAACGCCAGCTGACCGaa  >  1:33501/1‑70 (MQ=255) tCTTGATCTGCTCTTTGAAGATTTGGCCTTACCGAATCTGAAACAAAACCAACAACGCCAGCTGACCGaa  >  1:328134/1‑70 (MQ=255) tCTTGATCTGCTCTTTGAAGATTTGGCCTTACCGAATCTGAAACAAAACCAACAACGCCAGCTGACCGaa  >  1:301025/1‑70 (MQ=255) tCTTGATCTGCTCTTTGAAGATTTGGCCTTACCGAATCTGAAACAAAACCAACAACGCCAGCTGACCGaa  >  1:268410/1‑70 (MQ=255) tCTTGATCTGCTCTTTGAAGATTTGGCCTTACCGAATCTGAAACAAAACCAACAACGCCAGCTGACCGaa  >  1:240617/1‑70 (MQ=255) tCTTGATCTGCTCTTTGAAGATTTGGCCTTACCGAATCTGAAACAAAACCAACAACGCCAGCTGACCGaa  >  1:208736/1‑70 (MQ=255) tCTTGATCTGCTCTTTGAAGATTTGGCCTTACCGAATCTGAAACAAAACCAACAACGCCAGCTGACCGaa  >  1:204581/1‑70 (MQ=255) tCTTGATCTGCTCTTTGAAGATTTGGCCTTACCGAATCTGAAACAAAACCAACAACGCCAGCTGACCGaa  >  1:171815/1‑70 (MQ=255) tCTTGATCTGCTCTTTGAAGATTTGGCCTTACCGAATCTGAAACAAAACCAACAACGCCAGCTGACCGa   >  1:297052/1‑69 (MQ=255) tCTTGATCTGCTCTGTGAAGATTTGGCCTTACCGAATCTGAAACAAAACCAACAACGCCAGCTGACCGaa  >  1:592749/1‑70 (MQ=255) tCTTGATCTACTCTTTGAAGATTTGGCCTTACCGAATCTGAAACAAAACCAACAACGCCAGCTGACCGaa  >  1:505920/1‑70 (MQ=255) |                                                                      TCTTGATCTGCTCTTTGAAGATTTGGCCTTACCGAATCTGAAACAAAACCAACAACGCCAGCTGACCGAA  >  minE/1186454‑1186523

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑