Missing coverage evidence...
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TCATTAAAACCTATCGTCGTAATCGAATGATTGTTTGTACGATTTGCGCACTCGTTACGCTCGCTTCGACC  >  minE/1202362‑1202432 |                                                                       tCATTAAAACCTATCGTCGTAATCGAATGATTGTTTGTACGATTTGCGCACTCGTTACGCTCGCTTCGAcc  >  1:337409/1‑71 (MQ=255) tCATTAAAACCTATCGTCGTAATCGAATGATTGTTTGTACGATTTGCGCACTCGTTACGCTCGCTTCGAcc  >  1:632772/1‑71 (MQ=255) tCATTAAAACCTATCGTCGTAATCGAATGATTGTTTGTACGATTTGCGCACTCGTTACGCTCGCTTCGAcc  >  1:619032/1‑71 (MQ=255) tCATTAAAACCTATCGTCGTAATCGAATGATTGTTTGTACGATTTGCGCACTCGTTACGCTCGCTTCGAcc  >  1:616992/1‑71 (MQ=255) tCATTAAAACCTATCGTCGTAATCGAATGATTGTTTGTACGATTTGCGCACTCGTTACGCTCGCTTCGAcc  >  1:590388/1‑71 (MQ=255) tCATTAAAACCTATCGTCGTAATCGAATGATTGTTTGTACGATTTGCGCACTCGTTACGCTCGCTTCGAcc  >  1:566810/1‑71 (MQ=255) tCATTAAAACCTATCGTCGTAATCGAATGATTGTTTGTACGATTTGCGCACTCGTTACGCTCGCTTCGAcc  >  1:555480/1‑71 (MQ=255) tCATTAAAACCTATCGTCGTAATCGAATGATTGTTTGTACGATTTGCGCACTCGTTACGCTCGCTTCGAcc  >  1:519596/1‑71 (MQ=255) tCATTAAAACCTATCGTCGTAATCGAATGATTGTTTGTACGATTTGCGCACTCGTTACGCTCGCTTCGAcc  >  1:493670/1‑71 (MQ=255) tCATTAAAACCTATCGTCGTAATCGAATGATTGTTTGTACGATTTGCGCACTCGTTACGCTCGCTTCGAcc  >  1:47030/1‑71 (MQ=255) tCATTAAAACCTATCGTCGTAATCGAATGATTGTTTGTACGATTTGCGCACTCGTTACGCTCGCTTCGAcc  >  1:466437/1‑71 (MQ=255) tCATTAAAACCTATCGTCGTAATCGAATGATTGTTTGTACGATTTGCGCACTCGTTACGCTCGCTTCGAcc  >  1:454061/1‑71 (MQ=255) tCATTAAAACCTATCGTCGTAATCGAATGATTGTTTGTACGATTTGCGCACTCGTTACGCTCGCTTCGAcc  >  1:408535/1‑71 (MQ=255) tCATTAAAACCTATCGTCGTAATCGAATGATTGTTTGTACGATTTGCGCACTCGTTACGCTCGCTTCGAcc  >  1:376214/1‑71 (MQ=255) tCATTAAAACCTATCGTCGTAATCGAATGATTGTTTGTACGATTTGCGCACTCGTTACGCTCGCTTCGAcc  >  1:348866/1‑71 (MQ=255) tCATTAAAACCTATCGTCGTAATCGAATGATTGTTTGTACGATTTGCGCACTCGTTACGCTCGCTTCGAcc  >  1:120038/1‑71 (MQ=255) tCATTAAAACCTATCGTCGTAATCGAATGATTGTTTGTACGATTTGCGCACTCGTTACGCTCGCTTCGAcc  >  1:336653/1‑71 (MQ=255) tCATTAAAACCTATCGTCGTAATCGAATGATTGTTTGTACGATTTGCGCACTCGTTACGCTCGCTTCGAcc  >  1:33260/1‑71 (MQ=255) tCATTAAAACCTATCGTCGTAATCGAATGATTGTTTGTACGATTTGCGCACTCGTTACGCTCGCTTCGAcc  >  1:32603/1‑71 (MQ=255) tCATTAAAACCTATCGTCGTAATCGAATGATTGTTTGTACGATTTGCGCACTCGTTACGCTCGCTTCGAcc  >  1:309424/1‑71 (MQ=255) tCATTAAAACCTATCGTCGTAATCGAATGATTGTTTGTACGATTTGCGCACTCGTTACGCTCGCTTCGAcc  >  1:290462/1‑71 (MQ=255) tCATTAAAACCTATCGTCGTAATCGAATGATTGTTTGTACGATTTGCGCACTCGTTACGCTCGCTTCGAcc  >  1:273423/1‑71 (MQ=255) tCATTAAAACCTATCGTCGTAATCGAATGATTGTTTGTACGATTTGCGCACTCGTTACGCTCGCTTCGAcc  >  1:211925/1‑71 (MQ=255) tCATTAAAACCTATCGTCGTAATCGAATGATTGTTTGTACGATTTGCGCACTCGTTACGCTCGCTTCGAcc  >  1:200905/1‑71 (MQ=255) tCATTAAAACCTATCGTCGTAATCGAATGATTGTTTGTACGATTTGCGCACTCGTTACGCTCGCTTCGAcc  >  1:182132/1‑71 (MQ=255) tCATTAAAACCTATCGTCGTAATCGAATGATTGTTTGTACGATTTGCGCACTCGTTACGCTCGCTTCGAcc  >  1:177760/1‑71 (MQ=255) tCATTAAAACCTATCGTCGTAATCGAATGATTGTTTGTACGATTTGCGCACTCGTTACGCTCGCTTCGAcc  >  1:169616/1‑71 (MQ=255) tCATTAAAACCTATCGTCGTAATCGAATGATTGTTTGTACGATTTGCGCACTCGTTACGCTCGCTTCGAcc  >  1:142708/1‑71 (MQ=255) tCATTAAAACCTATCGTCGTAATCGAATGATTGTTTGTACGATTTGCGCACTCGTTACGCTCGCTTCGAcc  >  1:122794/1‑71 (MQ=255) |                                                                       TCATTAAAACCTATCGTCGTAATCGAATGATTGTTTGTACGATTTGCGCACTCGTTACGCTCGCTTCGACC  >  minE/1202362‑1202432

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑