Missing coverage evidence...
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GACCATCATTGCCGGCCTTCCCGTTGAATATAACGATCGCTTTATTCGTGGAATTGCGGTGTTCGCACCGT  >  minE/1229589‑1229659 |                                                                       gACCATCATTGCCGGCCTTCCCGTTGAATATAACGATCGCTTTATTCGTGGAATTGCGGTGTTCGCACCg   >  1:108813/1‑70 (MQ=255) gACCATCATTGCCGGCCTTCCCGTTGAATATAACGATCGCTTTATTCGTGGAATTGCGGTGTTCGCACCg   >  1:149923/1‑70 (MQ=255) gACCATCATTGCCGGCCTTCCCGTTGAATATAACGATCGCTTTATTCGTGGAATTGCGGTGTTCGCACCGt  >  1:119684/1‑71 (MQ=255) gACCATCATTGCCGGCCTTCCCGTTGAATATAACGATCGCTTTATTCGTGGAATTGCGGTGTTCGCACCGt  >  1:88639/1‑71 (MQ=255) gACCATCATTGCCGGCCTTCCCGTTGAATATAACGATCGCTTTATTCGTGGAATTGCGGTGTTCGCACCGt  >  1:85857/1‑71 (MQ=255) gACCATCATTGCCGGCCTTCCCGTTGAATATAACGATCGCTTTATTCGTGGAATTGCGGTGTTCGCACCGt  >  1:68939/1‑71 (MQ=255) gACCATCATTGCCGGCCTTCCCGTTGAATATAACGATCGCTTTATTCGTGGAATTGCGGTGTTCGCACCGt  >  1:639882/1‑71 (MQ=255) gACCATCATTGCCGGCCTTCCCGTTGAATATAACGATCGCTTTATTCGTGGAATTGCGGTGTTCGCACCGt  >  1:638712/1‑71 (MQ=255) gACCATCATTGCCGGCCTTCCCGTTGAATATAACGATCGCTTTATTCGTGGAATTGCGGTGTTCGCACCGt  >  1:619099/1‑71 (MQ=255) gACCATCATTGCCGGCCTTCCCGTTGAATATAACGATCGCTTTATTCGTGGAATTGCGGTGTTCGCACCGt  >  1:544589/1‑71 (MQ=255) gACCATCATTGCCGGCCTTCCCGTTGAATATAACGATCGCTTTATTCGTGGAATTGCGGTGTTCGCACCGt  >  1:510010/1‑71 (MQ=255) gACCATCATTGCCGGCCTTCCCGTTGAATATAACGATCGCTTTATTCGTGGAATTGCGGTGTTCGCACCGt  >  1:507507/1‑71 (MQ=255) gACCATCATTGCCGGCCTTCCCGTTGAATATAACGATCGCTTTATTCGTGGAATTGCGGTGTTCGCACCGt  >  1:428444/1‑71 (MQ=255) gACCATCATTGCCGGCCTTCCCGTTGAATATAACGATCGCTTTATTCGTGGAATTGCGGTGTTCGCACCGt  >  1:40677/1‑71 (MQ=255) gACCATCATTGCCGGCCTTCCCGTTGAATATAACGATCGCTTTATTCGTGGAATTGCGGTGTTCGCACCGt  >  1:344512/1‑71 (MQ=255) gACCATCATTGCCGGCCTTCCCGTTGAATATAACGATCGCTTTATTCGTGGAATTGCGGTGTTCGCACCGt  >  1:334467/1‑71 (MQ=255) gACCATCATTGCCGGCCTTCCCGTTGAATATAACGATCGCTTTATTCGTGGAATTGCGGTGTTCGCACCGt  >  1:334268/1‑71 (MQ=255) gACCATCATTGCCGGCCTTCCCGTTGAATATAACGATCGCTTTATTCGTGGAATTGCGGTGTTCGCACCGt  >  1:170012/1‑71 (MQ=255) gACCATCATTGCCGGCCTTCCCGTTGAATATAACGATCGCTTTATTCGTGGAATTGCGGTGTTCGCACCGt  >  1:139235/1‑71 (MQ=255) gACCATCATTGCCGGCCTTCCCCTTGAATAAAACGATCGCTTTATTCGTGGAATTg                 >  1:471387/1‑56 (MQ=255) |                                                                       GACCATCATTGCCGGCCTTCCCGTTGAATATAACGATCGCTTTATTCGTGGAATTGCGGTGTTCGCACCGT  >  minE/1229589‑1229659

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑