Missing coverage evidence...
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ACAGATGGCCGATATCACCGGACGTCCGTCGTTGATGACGACCTTCACCTTTGGCAAATACCGTGGCAAAG  >  minE/1230512‑1230582 |                                                                       aCAGATGGCCGATATCCCCGGACGTCCGTCGTTGATGACGACCTTCACCTTTGGCAAATACCGTGGCAAAg  >  1:141799/1‑71 (MQ=255) aCAGATGGCCGATATCACCGGACGTCCGTCGTTGATGCCGACCt                             >  1:18899/1‑44 (MQ=255) aCAGATGGCCGATATCACCGGACGTCCGTCGTTGATGACGCCCTTCCCCTTTGGCAAATACCGTGGCaaa   >  1:422027/1‑70 (MQ=255) aCAGATGGCCGATATCACCGGACGTCCGTCGTTGATGACGCCCTTCACCTTTGGCAAATACCGTGGCaaa   >  1:605690/1‑70 (MQ=255) aCAGATGGCCGATATCACCGGACGTCCGTCGTTGATGACGACCtt                            >  1:584585/1‑45 (MQ=255) aCAGATGGCCGATATCACCGGACGTCCGTCGTTGATGACGACCTTCACCt                       >  1:316018/1‑50 (MQ=255) aCAGATGGCCGATATCACCGGACGTCCGTCGTTGATGACGACCTTCACCTTTGGCAAATACCGTGGCaaa   >  1:641489/1‑70 (MQ=255) aCAGATGGCCGATATCACCGGACGTCCGTCGTTGATGACGACCTTCACCTTTGGCAAATACCGTGGCaaa   >  1:278519/1‑70 (MQ=255) aCAGATGGCCGATATCACCGGACGTCCGTCGTTGATGACGACCTTCACCTTTGGCAAATACCGTGGCaaa   >  1:389781/1‑70 (MQ=255) aCAGATGGCCGATATCACCGGACGTCCGTCGTTGATGACGACCTTCACCTTTGGCAAATACCGTGGCaaa   >  1:422428/1‑70 (MQ=255) aCAGATGGCCGATATCACCGGACGTCCGTCGTTGATGACGACCTTCACCTTTGGCAAATACCGTGGCAAAg  >  1:598842/1‑71 (MQ=255) aCAGATGGCCGATATCACCGGACGTCCGTCGTTGATGACGACCTTCACCTTTGGCAAATACCGTGGCAAAg  >  1:66851/1‑71 (MQ=255) aCAGATGGCCGATATCACCGGACGTCCGTCGTTGATGACGACCTTCACCTTTGGCAAATACCGTGGCAAAg  >  1:653376/1‑71 (MQ=255) aCAGATGGCCGATATCACCGGACGTCCGTCGTTGATGACGACCTTCACCTTTGGCAAATACCGTGGCAAAg  >  1:57259/1‑71 (MQ=255) aCAGATGGCCGATATCACCGGACGTCCGTCGTTGATGACGACCTTCACCTTTGGCAAATACCGTGGCAAAg  >  1:556760/1‑71 (MQ=255) aCAGATGGCCGATATCACCGGACGTCCGTCGTTGATGACGACCTTCACCTTTGGCAAATACCGTGGCAAAg  >  1:555072/1‑71 (MQ=255) aCAGATGGCCGATATCACCGGACGTCCGTCGTTGATGACGACCTTCACCTTTGGCAAATACCGTGGCAAAg  >  1:657340/1‑71 (MQ=255) aCAGATGGCCGATATCACCGGACGTCCGTCGTTGATGACGACCTTCACCTTTGGCAAATACCGTGGCAAAg  >  1:535742/1‑71 (MQ=255) aCAGATGGCCGATATCACCGGACGTCCGTCGTTGATGACGACCTTCACCTTTGGCAAATACCGTGGCAAAg  >  1:499940/1‑71 (MQ=255) aCAGATGGCCGATATCACCGGACGTCCGTCGTTGATGACGACCTTCACCTTTGGCAAATACCGTGGCAAAg  >  1:410707/1‑71 (MQ=255) aCAGATGGCCGATATCACCGGACGTCCGTCGTTGATGACGACCTTCACCTTTGGCAAATACCGTGGCAAAg  >  1:352532/1‑71 (MQ=255) aCAGATGGCCGATATCACCGGACGTCCGTCGTTGATGACGACCTTCACCTTTGGCAAATACCGTGGCAAAg  >  1:351534/1‑71 (MQ=255) aCAGATGGCCGATATCACCGGACGTCCGTCGTTGATGACGACCTTCACCTTTGGCAAATACCGTGGCAAAg  >  1:328820/1‑71 (MQ=255) aCAGATGGCCGATATCACCGGACGTCCGTCGTTGATGACGACCTTCACCTTTGGCAAATACCGTGGCAAAg  >  1:309613/1‑71 (MQ=255) aCAGATGGCCGATATCACCGGACGTCCGTCGTTGATGACGACCTTCACCTTTGGCAAATACCGTGGCAAAg  >  1:295531/1‑71 (MQ=255) aCAGATGGCCGATATCACCGGACGTCCGTCGTTGATGACGACCTTCACCTTTGGCAAATACCGTGGCAAAg  >  1:281598/1‑71 (MQ=255) aCAGATGGCCGATATCACCGGACGTCCGTCGTTGATGACGACCTTCACCTTTGGCAAATACCGTGGCAAAg  >  1:273184/1‑71 (MQ=255) aCAGATGGCCGATATCACCGGACGTCCGTCGTTGATGACGACCTTCACCTTTGGCAAATACCGTGGCAAAg  >  1:238623/1‑71 (MQ=255) aCAGATGGCCGATATCACCGGACGTCCGTCGTTGATGACGACCTTCACCTTTGGCAAATACCGTGGCAAAg  >  1:160366/1‑71 (MQ=255) aCAGATGGCCGATATCACCGGACGGCCGTCGTTGATGACGACCTTCACCTTTGGCAAATACCGTGGCAAAg  >  1:617638/1‑71 (MQ=255) |                                                                       ACAGATGGCCGATATCACCGGACGTCCGTCGTTGATGACGACCTTCACCTTTGGCAAATACCGTGGCAAAG  >  minE/1230512‑1230582

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑