Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1261192	1261271	80	5 [1]	[0] 32	torY	TMAO reductase III (TorYZ), cytochrome c‑type subunit

ACTTAATGTGGCTAGCGCCAGCCGTTGACCTGCCGCCAGGTAGAGCGTGTTTTCACTGCCCTGCATTTGAT  >  minE/1261272‑1261342 |                                                                       aCTTAATGTGGCTAGCGCCAGCCGTTGACCTGCCGCCAGGTAGAGCGTGTTTTCACTGCCCTGCATTTGAt  <  1:425290/71‑1 (MQ=255) aCTTAATGTGGCTAGCGCCAGCCGTTGACCTGCCGCCAGGTAGAGCGTGTTTTCACTGCCCTGCATTTGAt  <  1:629481/71‑1 (MQ=255) aCTTAATGTGGCTAGCGCCAGCCGTTGACCTGCCGCCAGGTAGAGCGTGTTTTCACTGCCCTGCATTTGAt  <  1:619133/71‑1 (MQ=255) aCTTAATGTGGCTAGCGCCAGCCGTTGACCTGCCGCCAGGTAGAGCGTGTTTTCACTGCCCTGCATTTGAt  <  1:584228/71‑1 (MQ=255) aCTTAATGTGGCTAGCGCCAGCCGTTGACCTGCCGCCAGGTAGAGCGTGTTTTCACTGCCCTGCATTTGAt  <  1:571352/71‑1 (MQ=255) aCTTAATGTGGCTAGCGCCAGCCGTTGACCTGCCGCCAGGTAGAGCGTGTTTTCACTGCCCTGCATTTGAt  <  1:554060/71‑1 (MQ=255) aCTTAATGTGGCTAGCGCCAGCCGTTGACCTGCCGCCAGGTAGAGCGTGTTTTCACTGCCCTGCATTTGAt  <  1:547595/71‑1 (MQ=255) aCTTAATGTGGCTAGCGCCAGCCGTTGACCTGCCGCCAGGTAGAGCGTGTTTTCACTGCCCTGCATTTGAt  <  1:523017/71‑1 (MQ=255) aCTTAATGTGGCTAGCGCCAGCCGTTGACCTGCCGCCAGGTAGAGCGTGTTTTCACTGCCCTGCATTTGAt  <  1:514060/71‑1 (MQ=255) aCTTAATGTGGCTAGCGCCAGCCGTTGACCTGCCGCCAGGTAGAGCGTGTTTTCACTGCCCTGCATTTGAt  <  1:491874/71‑1 (MQ=255) aCTTAATGTGGCTAGCGCCAGCCGTTGACCTGCCGCCAGGTAGAGCGTGTTTTCACTGCCCTGCATTTGAt  <  1:487592/71‑1 (MQ=255) aCTTAATGTGGCTAGCGCCAGCCGTTGACCTGCCGCCAGGTAGAGCGTGTTTTCACTGCCCTGCATTTGAt  <  1:471918/71‑1 (MQ=255) aCTTAATGTGGCTAGCGCCAGCCGTTGACCTGCCGCCAGGTAGAGCGTGTTTTCACTGCCCTGCATTTGAt  <  1:467838/71‑1 (MQ=255) aCTTAATGTGGCTAGCGCCAGCCGTTGACCTGCCGCCAGGTAGAGCGTGTTTTCACTGCCCTGCATTTGAt  <  1:46082/71‑1 (MQ=255) aCTTAATGTGGCTAGCGCCAGCCGTTGACCTGCCGCCAGGTAGAGCGTGTTTTCACTGCCCTGCATTTGAt  <  1:452550/71‑1 (MQ=255) aCTTAATGTGGCTAGCGCCAGCCGTTGACCTGCCGCCAGGTAGAGCGTGTTTTCACTGCCCTGCATTTGAt  <  1:169602/71‑1 (MQ=255) aCTTAATGTGGCTAGCGCCAGCCGTTGACCTGCCGCCAGGTAGAGCGTGTTTTCACTGCCCTGCATTTGAt  <  1:390411/71‑1 (MQ=255) aCTTAATGTGGCTAGCGCCAGCCGTTGACCTGCCGCCAGGTAGAGCGTGTTTTCACTGCCCTGCATTTGAt  <  1:384638/71‑1 (MQ=255) aCTTAATGTGGCTAGCGCCAGCCGTTGACCTGCCGCCAGGTAGAGCGTGTTTTCACTGCCCTGCATTTGAt  <  1:378494/71‑1 (MQ=255) aCTTAATGTGGCTAGCGCCAGCCGTTGACCTGCCGCCAGGTAGAGCGTGTTTTCACTGCCCTGCATTTGAt  <  1:371319/71‑1 (MQ=255) aCTTAATGTGGCTAGCGCCAGCCGTTGACCTGCCGCCAGGTAGAGCGTGTTTTCACTGCCCTGCATTTGAt  <  1:371213/71‑1 (MQ=255) aCTTAATGTGGCTAGCGCCAGCCGTTGACCTGCCGCCAGGTAGAGCGTGTTTTCACTGCCCTGCATTTGAt  <  1:329951/71‑1 (MQ=255) aCTTAATGTGGCTAGCGCCAGCCGTTGACCTGCCGCCAGGTAGAGCGTGTTTTCACTGCCCTGCATTTGAt  <  1:329660/71‑1 (MQ=255) aCTTAATGTGGCTAGCGCCAGCCGTTGACCTGCCGCCAGGTAGAGCGTGTTTTCACTGCCCTGCATTTGAt  <  1:269989/71‑1 (MQ=255) aCTTAATGTGGCTAGCGCCAGCCGTTGACCTGCCGCCAGGTAGAGCGTGTTTTCACTGCCCTGCATTTGAt  <  1:247373/71‑1 (MQ=255) aCTTAATGTGGCTAGCGCCAGCCGTTGACCTGCCGCCAGGTAGAGCGTGTTTTCACTGCCCTGCATTTGAt  <  1:226569/71‑1 (MQ=255) aCTTAATGTGGCTAGCGCCAGCCGTTGACCTGCCGCCAGGTAGAGCGTGTTTTCACTGCCCTGCATTTGAt  <  1:223739/71‑1 (MQ=255) aCTTAATGTGGCTAGCGCCAGCCGTTGACCTGCCGCCAGGTAGAGCGTGTTTTCACTGCCCTGCATTTGAt  <  1:209896/71‑1 (MQ=255) aCTTAATGTGGCTAGCGCCAGCCGTTGACCTGCCGCCAGGTAGAGCGTGTTTTCACTGCCCTGCATTTGAt  <  1:209332/71‑1 (MQ=255) aCTTAATGTGGCTAGCGCCAGCCGTTGACCTGCCGCCAGGTAGAGCGTGTTTTCACTGCCCTGCATTTGAt  <  1:192543/71‑1 (MQ=255) aCTTAATGTGGCTAGCGCCAGCCGTTGACCTGCCGCCAGGTAGAGCGTGTTTTCACTGCCCTGCATTTGAt  <  1:182540/71‑1 (MQ=255) aCTTAATGTGGCTAGCGCCAGCCGTTGACCTGCCGCCAGGTAGAGCGTGGTTTCACTGCCCTGCATTTGAt  <  1:512739/71‑1 (MQ=255) |                                                                       ACTTAATGTGGCTAGCGCCAGCCGTTGACCTGCCGCCAGGTAGAGCGTGTTTTCACTGCCCTGCATTTGAT  >  minE/1261272‑1261342

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑