Missing coverage evidence...
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CCACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTA  >  minE/1271069‑1271139 |                                                                       ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:529773/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:414402/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:429254/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:441384/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:442882/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:458796/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:464901/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:479893/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:493760/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:516299/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:409401/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:541235/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:554089/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:599295/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:601198/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:61147/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:629638/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:647112/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:647831/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:298092/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:120139/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:165626/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:170460/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:207411/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:220355/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:246345/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:286055/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:296836/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:102928/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:30053/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:335792/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:337731/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:338765/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:35410/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:361332/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:362025/71‑1 (MQ=255) ccACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTa  <  1:369812/71‑1 (MQ=255) |                                                                       CCACTGCAACGAGCTTTGCAGAACATACATGTTGCTAACCATCCGGCGAATCACATACCAGGAGATGAGTA  >  minE/1271069‑1271139

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑