Missing coverage evidence...
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TTTTCAGTTTTGTGATTAATCACATCGCCGTGGCAAACGTTGCCCTCGGCGGTGTGGGCGCTGATCTCC  >  minE/1332198‑1332266 |                                                                     ttttCAGTTTTGTGATTAATCACATCGCCGTGGCAAACGTTGCCCTCGGCGGTGTGGGCGCTGATCTcc  <  1:407840/69‑1 (MQ=255) ttttCAGTTTTGTGATTAATCACATCGCCGTGGCAAACGTTGCCCTCGGCGGTGTGGGCGCTGATCTcc  <  1:98366/69‑1 (MQ=255) ttttCAGTTTTGTGATTAATCACATCGCCGTGGCAAACGTTGCCCTCGGCGGTGTGGGCGCTGATCTcc  <  1:89400/69‑1 (MQ=255) ttttCAGTTTTGTGATTAATCACATCGCCGTGGCAAACGTTGCCCTCGGCGGTGTGGGCGCTGATCTcc  <  1:72819/69‑1 (MQ=255) ttttCAGTTTTGTGATTAATCACATCGCCGTGGCAAACGTTGCCCTCGGCGGTGTGGGCGCTGATCTcc  <  1:623894/69‑1 (MQ=255) ttttCAGTTTTGTGATTAATCACATCGCCGTGGCAAACGTTGCCCTCGGCGGTGTGGGCGCTGATCTcc  <  1:552566/69‑1 (MQ=255) ttttCAGTTTTGTGATTAATCACATCGCCGTGGCAAACGTTGCCCTCGGCGGTGTGGGCGCTGATCTcc  <  1:492558/69‑1 (MQ=255) ttttCAGTTTTGTGATTAATCACATCGCCGTGGCAAACGTTGCCCTCGGCGGTGTGGGCGCTGATCTcc  <  1:472096/69‑1 (MQ=255) ttttCAGTTTTGTGATTAATCACATCGCCGTGGCAAACGTTGCCCTCGGCGGTGTGGGCGCTGATCTcc  <  1:457232/69‑1 (MQ=255) ttttCAGTTTTGTGATTAATCACATCGCCGTGGCAAACGTTGCCCTCGGCGGTGTGGGCGCTGATCTcc  <  1:440756/69‑1 (MQ=255) ttttCAGTTTTGTGATTAATCACATCGCCGTGGCAAACGTTGCCCTCGGCGGTGTGGGCGCTGATCTcc  <  1:431261/69‑1 (MQ=255) ttttCAGTTTTGTGATTAATCACATCGCCGTGGCAAACGTTGCCCTCGGCGGTGTGGGCGCTGATCTcc  <  1:415728/69‑1 (MQ=255) ttttCAGTTTTGTGATTAATCACATCGCCGTGGCAAACGTTGCCCTCGGCGGTGTGGGCGCTGATCTcc  <  1:108641/69‑1 (MQ=255) ttttCAGTTTTGTGATTAATCACATCGCCGTGGCAAACGTTGCCCTCGGCGGTGTGGGCGCTGATCTcc  <  1:394902/69‑1 (MQ=255) ttttCAGTTTTGTGATTAATCACATCGCCGTGGCAAACGTTGCCCTCGGCGGTGTGGGCGCTGATCTcc  <  1:391713/69‑1 (MQ=255) ttttCAGTTTTGTGATTAATCACATCGCCGTGGCAAACGTTGCCCTCGGCGGTGTGGGCGCTGATCTcc  <  1:350335/69‑1 (MQ=255) ttttCAGTTTTGTGATTAATCACATCGCCGTGGCAAACGTTGCCCTCGGCGGTGTGGGCGCTGATCTcc  <  1:306119/69‑1 (MQ=255) ttttCAGTTTTGTGATTAATCACATCGCCGTGGCAAACGTTGCCCTCGGCGGTGTGGGCGCTGATCTcc  <  1:302915/69‑1 (MQ=255) ttttCAGTTTTGTGATTAATCACATCGCCGTGGCAAACGTTGCCCTCGGCGGTGTGGGCGCTGATCTcc  <  1:269269/69‑1 (MQ=255) ttttCAGTTTTGTGATTAATCACATCGCCGTGGCAAACGTTGCCCTCGGCGGTGTGGGCGCTGATCTcc  <  1:267679/69‑1 (MQ=255) ttttCAGTTTTGTGATTAATCACATCGCCGTGGCAAACGTTGCCCTCGGCGGTGTGGGCGCTGATCTcc  <  1:207433/69‑1 (MQ=255) ttttCAGTTTTGTGATTAATCACATCGCCGTGGCAAACGTTGCCCTCGGCGGTGTGGGCGCTGATCTcc  <  1:196028/69‑1 (MQ=255) ttttCAGTTTTGTGATTAATCACATCGCCGTGGCAAACGTTGCCCTCGGCGGTGTGGGCGCTGATCTcc  <  1:188089/69‑1 (MQ=255) ttttCAGTTTTGTGATTAATCACATCGCCGTGGCAAACGTTGCCCTCGGCGGTGTGGGCGCTGATCTcc  <  1:156007/69‑1 (MQ=255) |                                                                     TTTTCAGTTTTGTGATTAATCACATCGCCGTGGCAAACGTTGCCCTCGGCGGTGTGGGCGCTGATCTCC  >  minE/1332198‑1332266

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑