Missing coverage evidence...
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GCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTC  >  minE/1384555‑1384625 |                                                                       gCCCATCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTc  <  1:104438/71‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTc  <  1:334546/71‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTc  <  1:85500/71‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTc  <  1:336693/71‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTc  <  1:375697/71‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTc  <  1:389110/71‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTc  <  1:392666/71‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTc  <  1:402422/71‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTc  <  1:420491/71‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTc  <  1:427135/71‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTc  <  1:431891/71‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTc  <  1:476755/71‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTc  <  1:48674/71‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTc  <  1:525925/71‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTc  <  1:573929/71‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTc  <  1:581434/71‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTc  <  1:653012/71‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTc  <  1:100718/71‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTc  <  1:190100/71‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTc  <  1:112936/71‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTc  <  1:115628/71‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTc  <  1:136079/71‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTc  <  1:160128/71‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTc  <  1:161857/71‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTc  <  1:172936/71‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTc  <  1:17348/71‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTc  <  1:176719/71‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTc  <  1:196350/71‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTc  <  1:231233/71‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTc  <  1:237035/71‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTc  <  1:242484/71‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTc  <  1:258597/71‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTc  <  1:259269/71‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTc  <  1:261862/71‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGGGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTc  <  1:300293/71‑1 (MQ=255) |                                                                       GCCCAGCCCCCTTTCACCGTTACGGTGTCGGTGGCGTTATAAACCAGGTAGGCACGCGGACTCCAGTGTTC  >  minE/1384555‑1384625

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑