Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1410417	1410541	125	15 [0]	[0] 36	bcr	bicyclomycin/multidrug efflux system

GCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTGAC  >  minE/1410542‑1410612 |                                                                       gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:593887/71‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:471318/71‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:476405/71‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:47850/71‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:497884/71‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:53142/71‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:576648/71‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:587052/71‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:588721/71‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:455781/71‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:631877/71‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:647110/71‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:65319/71‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:656952/71‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:69951/71‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:76538/71‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:86630/71‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:92446/71‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:29549/71‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:138676/71‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:160998/71‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:18798/71‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:190948/71‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:20357/71‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:22821/71‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:277035/71‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:288710/71‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:134887/71‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:317060/71‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:330162/71‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:336700/71‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:350587/71‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:378139/71‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:40894/71‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:415000/71‑1 (MQ=255) gCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTgac  <  1:445846/71‑1 (MQ=255) |                                                                       GCTCAGGACACGTTTATGGCGGAACAGCGCCGCAAAGTTACCAATAGTGGTACGAATGTGAAATGGCTGAC  >  minE/1410542‑1410612

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑