Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1411388	1411412	25	6 [0]	[0] 32	rsuA	16S rRNA pseudouridylate 516 synthase

ACTTCCAGCACCGCAGGCTTAGTGAGATCTTTTTCGTTATGCAGCTGCACGCCTTTAGCAAATTGCTCTGC  >  minE/1411413‑1411483 |                                                                       aCTTCCCGCACCGCAGGCTTAGTGAGATCTTTTTCGTTATGCAGCTGCACGCCTTTAGCAAATTGCTCTGc  >  1:547361/1‑71 (MQ=255) aCTTCCAGCACCGCAGGCTTAGTGAGATCTTTTTCGTTATGCAGCTGCACGCCTTTAGCaa            >  1:308901/1‑61 (MQ=255) aCTTCCAGCACCGCAGGCTTAGTGAGATCTTTTTCGTTATGCAGCTGCACGCCTTTAGCAAATTGCTCTg   >  1:404157/1‑70 (MQ=255) aCTTCCAGCACCGCAGGCTTAGTGAGATCTTTTTCGTTATGCAGCTGCACGCCTTTAGCAAATTGCTCTg   >  1:360081/1‑70 (MQ=255) aCTTCCAGCACCGCAGGCTTAGTGAGATCTTTTTCGTTATGCAGCTGCACGCCTTTAGCAAATTGCTCTg   >  1:251498/1‑70 (MQ=255) aCTTCCAGCACCGCAGGCTTAGTGAGATCTTTTTCGTTATGCAGCTGCACGCCTTTAGCAAATTGCTCTg   >  1:124571/1‑70 (MQ=255) aCTTCCAGCACCGCAGGCTTAGTGAGATCTTTTTCGTTATGCAGCTGCACGCCTTTAGCAAATTGCTCTGc  >  1:577732/1‑71 (MQ=255) aCTTCCAGCACCGCAGGCTTAGTGAGATCTTTTTCGTTATGCAGCTGCACGCCTTTAGCAAATTGCTCTGc  >  1:565229/1‑71 (MQ=255) aCTTCCAGCACCGCAGGCTTAGTGAGATCTTTTTCGTTATGCAGCTGCACGCCTTTAGCAAATTGCTCTGc  >  1:599450/1‑71 (MQ=255) aCTTCCAGCACCGCAGGCTTAGTGAGATCTTTTTCGTTATGCAGCTGCACGCCTTTAGCAAATTGCTCTGc  >  1:55350/1‑71 (MQ=255) aCTTCCAGCACCGCAGGCTTAGTGAGATCTTTTTCGTTATGCAGCTGCACGCCTTTAGCAAATTGCTCTGc  >  1:635029/1‑71 (MQ=255) aCTTCCAGCACCGCAGGCTTAGTGAGATCTTTTTCGTTATGCAGCTGCACGCCTTTAGCAAATTGCTCTGc  >  1:104155/1‑71 (MQ=255) aCTTCCAGCACCGCAGGCTTAGTGAGATCTTTTTCGTTATGCAGCTGCACGCCTTTAGCAAATTGCTCTGc  >  1:524891/1‑71 (MQ=255) aCTTCCAGCACCGCAGGCTTAGTGAGATCTTTTTCGTTATGCAGCTGCACGCCTTTAGCAAATTGCTCTGc  >  1:522734/1‑71 (MQ=255) aCTTCCAGCACCGCAGGCTTAGTGAGATCTTTTTCGTTATGCAGCTGCACGCCTTTAGCAAATTGCTCTGc  >  1:498871/1‑71 (MQ=255) aCTTCCAGCACCGCAGGCTTAGTGAGATCTTTTTCGTTATGCAGCTGCACGCCTTTAGCAAATTGCTCTGc  >  1:45190/1‑71 (MQ=255) aCTTCCAGCACCGCAGGCTTAGTGAGATCTTTTTCGTTATGCAGCTGCACGCCTTTAGCAAATTGCTCTGc  >  1:4508/1‑71 (MQ=255) aCTTCCAGCACCGCAGGCTTAGTGAGATCTTTTTCGTTATGCAGCTGCACGCCTTTAGCAAATTGCTCTGc  >  1:406384/1‑71 (MQ=255) aCTTCCAGCACCGCAGGCTTAGTGAGATCTTTTTCGTTATGCAGCTGCACGCCTTTAGCAAATTGCTCTGc  >  1:648136/1‑71 (MQ=255) aCTTCCAGCACCGCAGGCTTAGTGAGATCTTTTTCGTTATGCAGCTGCACGCCTTTAGCAAATTGCTCTGc  >  1:391903/1‑71 (MQ=255) aCTTCCAGCACCGCAGGCTTAGTGAGATCTTTTTCGTTATGCAGCTGCACGCCTTTAGCAAATTGCTCTGc  >  1:391539/1‑71 (MQ=255) aCTTCCAGCACCGCAGGCTTAGTGAGATCTTTTTCGTTATGCAGCTGCACGCCTTTAGCAAATTGCTCTGc  >  1:360831/1‑71 (MQ=255) aCTTCCAGCACCGCAGGCTTAGTGAGATCTTTTTCGTTATGCAGCTGCACGCCTTTAGCAAATTGCTCTGc  >  1:346761/1‑71 (MQ=255) aCTTCCAGCACCGCAGGCTTAGTGAGATCTTTTTCGTTATGCAGCTGCACGCCTTTAGCAAATTGCTCTGc  >  1:343612/1‑71 (MQ=255) aCTTCCAGCACCGCAGGCTTAGTGAGATCTTTTTCGTTATGCAGCTGCACGCCTTTAGCAAATTGCTCTGc  >  1:33981/1‑71 (MQ=255) aCTTCCAGCACCGCAGGCTTAGTGAGATCTTTTTCGTTATGCAGCTGCACGCCTTTAGCAAATTGCTCTGc  >  1:29646/1‑71 (MQ=255) aCTTCCAGCACCGCAGGCTTAGTGAGATCTTTTTCGTTATGCAGCTGCACGCCTTTAGCAAATTGCTCTGc  >  1:244020/1‑71 (MQ=255) aCTTCCAGCACCGCAGGCTTAGTGAGATCTTTTTCGTTATGCAGCTGCACGCCTTTAGCAAATTGCTCTGc  >  1:229684/1‑71 (MQ=255) aCTTCCAGCACCGCAGGCTTAGTGAGATCTTTTTCGTTATGCAGCTGCACGCCTTTAGCAAATTGCTCTGc  >  1:211243/1‑71 (MQ=255) aCTTCCAGCACCGCAGGCTTAGTGAGATCTTTTTCGTTATGCAGCTGCACGCCTTTAGCAAATTGCTCTGc  >  1:184048/1‑71 (MQ=255) aCTTCCAGCACCGCAGGCTTAGTGAGATCTTTTTCGTTATGCAGCTGCACGCCTTTAGCAAATTGCTCTGc  >  1:153349/1‑71 (MQ=255) aCTTCCAGCACCGCAGGCTTAGTGAGATCTATTTCGTTATGCAGCTGCACGCCTTTAGCAAATTGCTCTGc  >  1:342190/1‑71 (MQ=255) |                                                                       ACTTCCAGCACCGCAGGCTTAGTGAGATCTTTTTCGTTATGCAGCTGCACGCCTTTAGCAAATTGCTCTGC  >  minE/1411413‑1411483

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑