Missing coverage evidence...
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AACGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACT  >  minE/1433353‑1433423 |                                                                       aaCGGATGCTTTACCTTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:44222/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:550479/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:372066/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:376472/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:414891/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:425493/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:470375/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:493649/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:517970/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:549820/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:365078/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:551895/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:556202/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:568170/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:610911/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:617186/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:654089/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:658216/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:87813/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:248718/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:163187/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:171692/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:172990/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:199579/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:206790/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:208910/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:211010/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:22300/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:227278/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:100074/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:249960/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:252875/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:277888/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:280359/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:343436/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:346417/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:351782/71‑1 (MQ=255) aaCGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACt  <  1:35218/71‑1 (MQ=255) |                                                                       AACGGATGCTTTACCGTAAACCTTCGCCAGATGGTGATTAACCACGTCCGGGTTTTCCGAAACAAGGAACT  >  minE/1433353‑1433423

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑