Missing coverage evidence...
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TCATCCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCCGCTGCGCAGTACCAGTGTGT  >  minE/1502047‑1502117 |                                                                       tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTa                          >  1:404569/1‑47 (MQ=255) tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCCGCTGCGCAGTACCAgtgtgt  >  1:6116/1‑71 (MQ=255) tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCCGCTGCGCAGTACCAgtgtgt  >  1:424100/1‑71 (MQ=255) tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCCGCTGCGCAGTACCAgtgtgt  >  1:43215/1‑71 (MQ=255) tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCCGCTGCGCAGTACCAgtgtgt  >  1:470516/1‑71 (MQ=255) tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCCGCTGCGCAGTACCAgtgtgt  >  1:475873/1‑71 (MQ=255) tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCCGCTGCGCAGTACCAgtgtgt  >  1:52204/1‑71 (MQ=255) tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCCGCTGCGCAGTACCAgtgtgt  >  1:55786/1‑71 (MQ=255) tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCCGCTGCGCAGTACCAgtgtgt  >  1:605779/1‑71 (MQ=255) tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCCGCTGCGCAGTACCAgtgtgt  >  1:607426/1‑71 (MQ=255) tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCCGCTGCGCAGTACCAgtgtgt  >  1:412065/1‑71 (MQ=255) tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCCGCTGCGCAGTACCAgtgtgt  >  1:612953/1‑71 (MQ=255) tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCCGCTGCGCAGTACCAgtgtgt  >  1:631714/1‑71 (MQ=255) tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCCGCTGCGCAGTACCAgtgtgt  >  1:636586/1‑71 (MQ=255) tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCCGCTGCGCAGTACCAgtgtgt  >  1:64942/1‑71 (MQ=255) tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCCGCTGCGCAGTACCAgtgtgt  >  1:658624/1‑71 (MQ=255) tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCCGCTGCGCAGTACCAgtgtgt  >  1:70357/1‑71 (MQ=255) tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCCGCTGCGCAGTACCAgtgtgt  >  1:76919/1‑71 (MQ=255) tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCCGCTGCGCAGTACCAgtgtgt  >  1:90311/1‑71 (MQ=255) tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCCGCTGCGCAGTACCAgtgtgt  >  1:318966/1‑71 (MQ=255) tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCCGCTGCGCAGTACCAgtgtgt  >  1:155052/1‑71 (MQ=255) tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCCGCTGCGCAGTACCAgtgtgt  >  1:190919/1‑71 (MQ=255) tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCCGCTGCGCAGTACCAgtgtgt  >  1:209355/1‑71 (MQ=255) tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCCGCTGCGCAGTACCAgtgtgt  >  1:224627/1‑71 (MQ=255) tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCCGCTGCGCAGTACCAgtgtgt  >  1:250334/1‑71 (MQ=255) tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCCGCTGCGCAGTACCAgtgtgt  >  1:253735/1‑71 (MQ=255) tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCCGCTGCGCAGTACCAgtgtgt  >  1:283872/1‑71 (MQ=255) tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCCGCTGCGCAGTACCAgtgtgt  >  1:143305/1‑71 (MQ=255) tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCCGCTGCGCAGTACCAgtgtgt  >  1:325453/1‑71 (MQ=255) tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCCGCTGCGCAGTACCAgtgtgt  >  1:336027/1‑71 (MQ=255) tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCCGCTGCGCAGTACCAgtgtgt  >  1:348301/1‑71 (MQ=255) tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCCGCTGCGCAGTACCAgtgtgt  >  1:365835/1‑71 (MQ=255) tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCCGCTGCGCAGTACCAgtgtgt  >  1:372656/1‑71 (MQ=255) tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCCGCTGCGCAGTACCAgtgtgt  >  1:387940/1‑71 (MQ=255) tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCAGCTGCGCAGTACCAgtgtgt  >  1:223516/1‑71 (MQ=255) tcatcCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTATTGCAATATGTATTACGCTGCGCAGTACCAgtgtga  >  1:377195/1‑70 (MQ=255) |                                                                       TCATCCAGCAATACAAGAGGGATCGGCTCGCCTTTTTGCAATATGTATTCCGCTGCGCAGTACCAGTGTGT  >  minE/1502047‑1502117

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑