Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1520577	1520762	186	26 [0]	[0] 17	truA	pseudouridylate synthase I

CGCCTTTTCCAGCTTCTCCTGCACACTGCGGACTTCGTTCTGCCGTTGCCAGCCGTAATACTTACTGCCGT  >  minE/1520763‑1520833 |                                                                       cgcCTTTTCCAGCTTCTCCTGCACACTGCGGACTTCGTTCTGCCGTTGCCAGCCGTAATACTTACTGCcgt  >  1:422373/1‑71 (MQ=255) cgcCTTTTCCAGCTTCTCCTGCACACTGCGGACTTCGTTCTGCCGTTGCCAGCCGTAATACTTACTGCcgt  >  1:94476/1‑71 (MQ=255) cgcCTTTTCCAGCTTCTCCTGCACACTGCGGACTTCGTTCTGCCGTTGCCAGCCGTAATACTTACTGCcgt  >  1:550875/1‑71 (MQ=255) cgcCTTTTCCAGCTTCTCCTGCACACTGCGGACTTCGTTCTGCCGTTGCCAGCCGTAATACTTACTGCcgt  >  1:537221/1‑71 (MQ=255) cgcCTTTTCCAGCTTCTCCTGCACACTGCGGACTTCGTTCTGCCGTTGCCAGCCGTAATACTTACTGCcgt  >  1:519914/1‑71 (MQ=255) cgcCTTTTCCAGCTTCTCCTGCACACTGCGGACTTCGTTCTGCCGTTGCCAGCCGTAATACTTACTGCcgt  >  1:427039/1‑71 (MQ=255) cgcCTTTTCCAGCTTCTCCTGCACACTGCGGACTTCGTTCTGCCGTTGCCAGCCGTAATACTTACTGCcgt  >  1:146106/1‑71 (MQ=255) cgcCTTTTCCAGCTTCTCCTGCACACTGCGGACTTCGTTCTGCCGTTGCCAGCCGTAATACTTACTGCcgt  >  1:330597/1‑71 (MQ=255) cgcCTTTTCCAGCTTCTCCTGCACACTGCGGACTTCGTTCTGCCGTTGCCAGCCGTAATACTTACTGCcgt  >  1:289722/1‑71 (MQ=255) cgcCTTTTCCAGCTTCTCCTGCACACTGCGGACTTCGTTCTGCCGTTGCCAGCCGTAATACTTACTGCcgt  >  1:225000/1‑71 (MQ=255) cgcCTTTTCCAGCTTCTCCTGCACACTGCGGACTTCGTTCTGCCGTTGCCAGCCGTAATACTTACTGCcgt  >  1:211960/1‑71 (MQ=255) cgcCTTTTCCAGCTTCTCCTGCACACTGCGGACTTCGTTCTGCCGTTGCCAGCCGTAATACTTACTGCcgt  >  1:173244/1‑71 (MQ=255) cgcCTTTTCCAGCTTCTCCTGCACACTGCGGACTTCGTTCTGCCGTTGCCAGCCGTAATACTTACTGCcg   >  1:383467/1‑70 (MQ=255) cgcCTTTTCCAGCTTCTCCTGCACACTGCGGACTTCGTTCTGCCGTTGCCAGCCGTAATACTTACTGCcg   >  1:447694/1‑70 (MQ=255) cgcCTTTTCCAGCTTCTCCTGCACACTGCGGACTTCGTTCTGCCGTTGCCAGCCGTAATACTTACTGCcg   >  1:511795/1‑70 (MQ=255) cgcCTTTTCCAGCTTCTCCTGCACACTGCGGACTTCGTTCTGCCGTTGCCAGCCGTAATACTTACTGCcg   >  1:602316/1‑70 (MQ=255) cgcCTTTTCCAGCTTCTCCAGCACACTGCGGACTTCGTTCTGCCGTTGCCAGCCGTAATACTTACTGCcgt  >  1:334661/1‑71 (MQ=255) |                                                                       CGCCTTTTCCAGCTTCTCCTGCACACTGCGGACTTCGTTCTGCCGTTGCCAGCCGTAATACTTACTGCCGT  >  minE/1520763‑1520833

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑