Missing coverage evidence...
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GGTTAGCGCAAAGGTCGCCCCATTTGTATTGTTGATGGCAACCTGCATTCCGTCGGTTTTTTCCATGCCAA  >  minE/1535414‑1535484 |                                                                       ggTTAGCGCAAAGGTCGCCCCTTTTGTATTGTTGATGGCAACCTGCATTCCGTCGGTTTTTTCCATGCCaa  >  1:370494/1‑71 (MQ=255) ggTTAGCGCAAAGGTCGCCCCATTTGTATTGTTGATgg                                   >  1:146831/1‑38 (MQ=255) ggTTAGCGCAAAGGTCGCCCCATTTGTATTGTTGATGGCAACCTGCATTCCGTCGGTTTTTTCCATGCCaa  >  1:59886/1‑71 (MQ=255) ggTTAGCGCAAAGGTCGCCCCATTTGTATTGTTGATGGCAACCTGCATTCCGTCGGTTTTTTCCATGCCaa  >  1:557810/1‑71 (MQ=255) ggTTAGCGCAAAGGTCGCCCCATTTGTATTGTTGATGGCAACCTGCATTCCGTCGGTTTTTTCCATGCCaa  >  1:553249/1‑71 (MQ=255) ggTTAGCGCAAAGGTCGCCCCATTTGTATTGTTGATGGCAACCTGCATTCCGTCGGTTTTTTCCATGCCaa  >  1:526976/1‑71 (MQ=255) ggTTAGCGCAAAGGTCGCCCCATTTGTATTGTTGATGGCAACCTGCATTCCGTCGGTTTTTTCCATGCCaa  >  1:513914/1‑71 (MQ=255) ggTTAGCGCAAAGGTCGCCCCATTTGTATTGTTGATGGCAACCTGCATTCCGTCGGTTTTTTCCATGCCaa  >  1:492603/1‑71 (MQ=255) ggTTAGCGCAAAGGTCGCCCCATTTGTATTGTTGATGGCAACCTGCATTCCGTCGGTTTTTTCCATGCCaa  >  1:489109/1‑71 (MQ=255) ggTTAGCGCAAAGGTCGCCCCATTTGTATTGTTGATGGCAACCTGCATTCCGTCGGTTTTTTCCATGCCaa  >  1:451243/1‑71 (MQ=255) ggTTAGCGCAAAGGTCGCCCCATTTGTATTGTTGATGGCAACCTGCATTCCGTCGGTTTTTTCCATGCCaa  >  1:445097/1‑71 (MQ=255) ggTTAGCGCAAAGGTCGCCCCATTTGTATTGTTGATGGCAACCTGCATTCCGTCGGTTTTTTCCATGCCaa  >  1:436058/1‑71 (MQ=255) ggTTAGCGCAAAGGTCGCCCCATTTGTATTGTTGATGGCAACCTGCATTCCGTCGGTTTTTTCCATGCCaa  >  1:334358/1‑71 (MQ=255) ggTTAGCGCAAAGGTCGCCCCATTTGTATTGTTGATGGCAACCTGCATTCCGTCGGTTTTTTCCATGCCaa  >  1:334298/1‑71 (MQ=255) ggTTAGCGCAAAGGTCGCCCCATTTGTATTGTTGATGGCAACCTGCATTCCGTCGGTTTTTTCCATGCCaa  >  1:333498/1‑71 (MQ=255) ggTTAGCGCAAAGGTCGCCCCATTTGTATTGTTGATGGCAACCTGCATTCCGTCGGTTTTTTCCATGCCaa  >  1:277155/1‑71 (MQ=255) ggTTAGCGCAAAGGTCGCCCCATTTGTATTGTTGATGGCAACCTGCATTCCGTCGGTTTTTTCCATGCCaa  >  1:265393/1‑71 (MQ=255) ggTTAGCGCAAAGGTCGCCCCATTTGTATTGTTGATGGCAACCTGCATTCCGTCGGTTTTTTCCATGCCaa  >  1:200823/1‑71 (MQ=255) ggTTAGCGCAAAGGTCGCCCCATTTGTATTGTTGATGGCAACCTGCATTCCGTCGGTTTTTTCCATGCCaa  >  1:162178/1‑71 (MQ=255) ggTTAGCGCAAAGGTCGCCCCATTTGTATTGTTGATGGCAACCTGCATTCCGTCGGTTTCTTCCATGCCaa  >  1:140132/1‑71 (MQ=255) |                                                                       GGTTAGCGCAAAGGTCGCCCCATTTGTATTGTTGATGGCAACCTGCATTCCGTCGGTTTTTTCCATGCCAA  >  minE/1535414‑1535484

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑