Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1560974 1561590 617 5 [0] [0] 16 evgS hybrid sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with EvgA

GCGAGCAATTTTATATTGTTACGACATTATCCGTTTTATT  >  minE/1561591‑1561630
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gCGAGCAATTTTATATTGTTACGACATTATCCGTTttatt  <  1:137213/40‑1 (MQ=255)
gCGAGCAATTTTATATTGTTACGACATTATCCGTTttatt  <  1:177867/40‑1 (MQ=255)
gCGAGCAATTTTATATTGTTACGACATTATCCGTTttatt  <  1:254543/40‑1 (MQ=255)
gCGAGCAATTTTATATTGTTACGACATTATCCGTTttatt  <  1:255136/40‑1 (MQ=255)
gCGAGCAATTTTATATTGTTACGACATTATCCGTTttatt  <  1:271953/40‑1 (MQ=255)
gCGAGCAATTTTATATTGTTACGACATTATCCGTTttatt  <  1:400607/40‑1 (MQ=255)
gCGAGCAATTTTATATTGTTACGACATTATCCGTTttatt  <  1:414303/40‑1 (MQ=255)
gCGAGCAATTTTATATTGTTACGACATTATCCGTTttatt  <  1:463244/40‑1 (MQ=255)
gCGAGCAATTTTATATTGTTACGACATTATCCGTTttatt  <  1:466349/40‑1 (MQ=255)
gCGAGCAATTTTATATTGTTACGACATTATCCGTTttatt  <  1:523302/40‑1 (MQ=255)
gCGAGCAATTTTATATTGTTACGACATTATCCGTTttatt  <  1:590047/40‑1 (MQ=255)
gCGAGCAATTTTATATTGTTACGACATTATCCGTTttatt  <  1:638418/40‑1 (MQ=255)
gCGAGCAATTTTATATTGTTACGACATTATCCGTTttatt  <  1:648638/40‑1 (MQ=255)
gCGAGCAATTTTATATTGTTACGACATTATCCGTTttatt  <  1:649897/40‑1 (MQ=255)
gCGAGCAATTTTATATTGTTACGACATTATCCGTTttatt  <  1:649930/40‑1 (MQ=255)
gCGAGCAATTTTATATTGTTACGACATTATCCGTTttatt  <  1:84814/40‑1 (MQ=255)
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GCGAGCAATTTTATATTGTTACGACATTATCCGTTTTATT  >  minE/1561591‑1561630

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: