Missing coverage evidence...
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ACTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCTAT  >  minE/1564116‑1564185 |                                                                      aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTTCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:137756/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:563199/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:443899/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:460705/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:463818/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:490274/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:493429/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:499532/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:500507/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:503057/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:511351/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:537464/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:54304/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:439261/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:56642/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:577830/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:601272/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:625367/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:628333/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:649132/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:655314/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:6559/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:98271/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:314736/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:1122/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:118973/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:146217/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:180681/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:198815/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:238622/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:240899/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:273245/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:274604/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:275624/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:298900/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:103896/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:331341/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:342839/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:35678/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:377862/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:384317/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:388393/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:394411/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:405672/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:429074/70‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGTTGCGAAATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCtat  <  1:497278/70‑1 (MQ=255) |                                                                      ACTTCCCAGTTGCGATATATGCCATCAGACCATGCTCCAGAAAACTCAGCGTGGCATCAAACATCGCTAT  >  minE/1564116‑1564185

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑