Missing coverage evidence...
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GTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGC  >  minE/1606419‑1606488 |                                                                      gTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGc  <  1:39917/70‑1 (MQ=255) gTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGc  <  1:644238/70‑1 (MQ=255) gTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGc  <  1:639996/70‑1 (MQ=255) gTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGc  <  1:63550/70‑1 (MQ=255) gTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGc  <  1:631242/70‑1 (MQ=255) gTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGc  <  1:585191/70‑1 (MQ=255) gTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGc  <  1:545604/70‑1 (MQ=255) gTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGc  <  1:50661/70‑1 (MQ=255) gTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGc  <  1:466168/70‑1 (MQ=255) gTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGc  <  1:462391/70‑1 (MQ=255) gTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGc  <  1:426924/70‑1 (MQ=255) gTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGc  <  1:424984/70‑1 (MQ=255) gTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGc  <  1:400781/70‑1 (MQ=255) gTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGc  <  1:400107/70‑1 (MQ=255) gTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGc  <  1:118865/70‑1 (MQ=255) gTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGc  <  1:385797/70‑1 (MQ=255) gTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGc  <  1:365528/70‑1 (MQ=255) gTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGc  <  1:358366/70‑1 (MQ=255) gTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGc  <  1:348778/70‑1 (MQ=255) gTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGc  <  1:340712/70‑1 (MQ=255) gTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGc  <  1:299601/70‑1 (MQ=255) gTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGc  <  1:297344/70‑1 (MQ=255) gTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGc  <  1:235838/70‑1 (MQ=255) gTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGc  <  1:211785/70‑1 (MQ=255) gTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGc  <  1:207873/70‑1 (MQ=255) gTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGc  <  1:167041/70‑1 (MQ=255) gTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGc  <  1:149003/70‑1 (MQ=255) gTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGc  <  1:134134/70‑1 (MQ=255) gTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGc  <  1:120917/70‑1 (MQ=255) gTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAAAAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGc  <  1:464746/70‑1 (MQ=255) |                                                                      GTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGC  >  minE/1606419‑1606488

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑