Missing coverage evidence...
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ATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGT  >  minE/1610428‑1610498 |                                                                       aTAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGt  <  1:384332/71‑1 (MQ=255) aTAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGt  <  1:98935/71‑1 (MQ=255) aTAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGt  <  1:96340/71‑1 (MQ=255) aTAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGt  <  1:83100/71‑1 (MQ=255) aTAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGt  <  1:659766/71‑1 (MQ=255) aTAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGt  <  1:654474/71‑1 (MQ=255) aTAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGt  <  1:528046/71‑1 (MQ=255) aTAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGt  <  1:487954/71‑1 (MQ=255) aTAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGt  <  1:467350/71‑1 (MQ=255) aTAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGt  <  1:464595/71‑1 (MQ=255) aTAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGt  <  1:460587/71‑1 (MQ=255) aTAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGt  <  1:435176/71‑1 (MQ=255) aTAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGt  <  1:43219/71‑1 (MQ=255) aTAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGt  <  1:38883/71‑1 (MQ=255) aTAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGt  <  1:127964/71‑1 (MQ=255) aTAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGt  <  1:381615/71‑1 (MQ=255) aTAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGt  <  1:327701/71‑1 (MQ=255) aTAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGt  <  1:322093/71‑1 (MQ=255) aTAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGt  <  1:3041/71‑1 (MQ=255) aTAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGt  <  1:29076/71‑1 (MQ=255) aTAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGt  <  1:269722/71‑1 (MQ=255) aTAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGt  <  1:25488/71‑1 (MQ=255) aTAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGt  <  1:217557/71‑1 (MQ=255) aTAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGt  <  1:209231/71‑1 (MQ=255) aTAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGt  <  1:200182/71‑1 (MQ=255) aTAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGt  <  1:186955/71‑1 (MQ=255) aTAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGt  <  1:158757/71‑1 (MQ=255) aTAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGt  <  1:158172/71‑1 (MQ=255) |                                                                       ATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGT  >  minE/1610428‑1610498

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑