Missing coverage evidence...
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GGGAGTCGGTGTTGCCTTCTAACGTTGCGGCTCGCGTGGCGGTGGAAGCAGGTATTGCCGATTACTGGTAC  >  minE/1627690‑1627760 |                                                                       gggAGTCGGTGTTGCCTTCTAACGTTGCGGCTCGCGTGGCGGTGGAAGCTGGTATTGCCGATTACTGGTAc  <  1:157965/71‑1 (MQ=255) gggAGTCGGTGTTGCCTTCTAACGTTGCGGCTCGCGTGGCGGTGGAAGCAGGTATTGCCGATTAGTGGTAc  <  1:170314/71‑1 (MQ=255) gggAGTCGGTGTTGCCTTCTAACGTTGCGGCTCGCGTGGCGGTGGAAGCAGGTATTGCCGATTACTGGTAc  <  1:410638/71‑1 (MQ=255) gggAGTCGGTGTTGCCTTCTAACGTTGCGGCTCGCGTGGCGGTGGAAGCAGGTATTGCCGATTACTGGTAc  <  1:8662/71‑1 (MQ=255) gggAGTCGGTGTTGCCTTCTAACGTTGCGGCTCGCGTGGCGGTGGAAGCAGGTATTGCCGATTACTGGTAc  <  1:73983/71‑1 (MQ=255) gggAGTCGGTGTTGCCTTCTAACGTTGCGGCTCGCGTGGCGGTGGAAGCAGGTATTGCCGATTACTGGTAc  <  1:625709/71‑1 (MQ=255) gggAGTCGGTGTTGCCTTCTAACGTTGCGGCTCGCGTGGCGGTGGAAGCAGGTATTGCCGATTACTGGTAc  <  1:617784/71‑1 (MQ=255) gggAGTCGGTGTTGCCTTCTAACGTTGCGGCTCGCGTGGCGGTGGAAGCAGGTATTGCCGATTACTGGTAc  <  1:615943/71‑1 (MQ=255) gggAGTCGGTGTTGCCTTCTAACGTTGCGGCTCGCGTGGCGGTGGAAGCAGGTATTGCCGATTACTGGTAc  <  1:583603/71‑1 (MQ=255) gggAGTCGGTGTTGCCTTCTAACGTTGCGGCTCGCGTGGCGGTGGAAGCAGGTATTGCCGATTACTGGTAc  <  1:569072/71‑1 (MQ=255) gggAGTCGGTGTTGCCTTCTAACGTTGCGGCTCGCGTGGCGGTGGAAGCAGGTATTGCCGATTACTGGTAc  <  1:543542/71‑1 (MQ=255) gggAGTCGGTGTTGCCTTCTAACGTTGCGGCTCGCGTGGCGGTGGAAGCAGGTATTGCCGATTACTGGTAc  <  1:539876/71‑1 (MQ=255) gggAGTCGGTGTTGCCTTCTAACGTTGCGGCTCGCGTGGCGGTGGAAGCAGGTATTGCCGATTACTGGTAc  <  1:530100/71‑1 (MQ=255) gggAGTCGGTGTTGCCTTCTAACGTTGCGGCTCGCGTGGCGGTGGAAGCAGGTATTGCCGATTACTGGTAc  <  1:505360/71‑1 (MQ=255) gggAGTCGGTGTTGCCTTCTAACGTTGCGGCTCGCGTGGCGGTGGAAGCAGGTATTGCCGATTACTGGTAc  <  1:499405/71‑1 (MQ=255) gggAGTCGGTGTTGCCTTCTAACGTTGCGGCTCGCGTGGCGGTGGAAGCAGGTATTGCCGATTACTGGTAc  <  1:428212/71‑1 (MQ=255) gggAGTCGGTGTTGCCTTCTAACGTTGCGGCTCGCGTGGCGGTGGAAGCAGGTATTGCCGATTACTGGTAc  <  1:125179/71‑1 (MQ=255) gggAGTCGGTGTTGCCTTCTAACGTTGCGGCTCGCGTGGCGGTGGAAGCAGGTATTGCCGATTACTGGTAc  <  1:384764/71‑1 (MQ=255) gggAGTCGGTGTTGCCTTCTAACGTTGCGGCTCGCGTGGCGGTGGAAGCAGGTATTGCCGATTACTGGTAc  <  1:379123/71‑1 (MQ=255) gggAGTCGGTGTTGCCTTCTAACGTTGCGGCTCGCGTGGCGGTGGAAGCAGGTATTGCCGATTACTGGTAc  <  1:375811/71‑1 (MQ=255) gggAGTCGGTGTTGCCTTCTAACGTTGCGGCTCGCGTGGCGGTGGAAGCAGGTATTGCCGATTACTGGTAc  <  1:343198/71‑1 (MQ=255) gggAGTCGGTGTTGCCTTCTAACGTTGCGGCTCGCGTGGCGGTGGAAGCAGGTATTGCCGATTACTGGTAc  <  1:329564/71‑1 (MQ=255) gggAGTCGGTGTTGCCTTCTAACGTTGCGGCTCGCGTGGCGGTGGAAGCAGGTATTGCCGATTACTGGTAc  <  1:30388/71‑1 (MQ=255) gggAGTCGGTGTTGCCTTCTAACGTTGCGGCTCGCGTGGCGGTGGAAGCAGGTATTGCCGATTACTGGTAc  <  1:292152/71‑1 (MQ=255) gggAGTCGGTGTTGCCTTCTAACGTTGCGGCTCGCGTGGCGGTGGAAGCAGGTATTGCCGATTACTGGTAc  <  1:28619/71‑1 (MQ=255) gggAGTCGGTGTTGCCTTCTAACGTTGCGGCTCGCGTGGCGGTGGAAGCAGGTATTGCCGATTACTGGTAc  <  1:271425/71‑1 (MQ=255) gggAGTCGGTGTTGCCTTCTAACGTTGCGGCTCGCGTGGCGGTGGAAGCAGGTATTGCCGATTACTGGTAc  <  1:197476/71‑1 (MQ=255) gggAGTCGGTGTTGCCTTCTAACGTTGCGGCTCGCGTGGCGGTGGAAGCAGGTATTGCCGATTACTGGTAc  <  1:178984/71‑1 (MQ=255) gggAGTCGGTGTTGCCTTCTAACGTTGCGGCTCGCGTGGCGGTGGAAGCAGGTATTGCCGATTACTGGTAc  <  1:172374/71‑1 (MQ=255) gggAGTCGGTGTTGCCTTCTAACGTTGCGGCTCGCGTGGCGGTGGAAGCAGGTATTGCCGATTACTGGTAc  <  1:149805/71‑1 (MQ=255) gggAGTCGGTGTTGCCTTCTAACGTTGCGGCTCGCGTAGCGGTGGAAGCAGGTATTGCCGATTACTGGTAc  <  1:80170/71‑1 (MQ=255) gggAGTCGGTGTTGCCTTCTAACGTTGCAGCTCGCGTGGCGGTGGAAGCAGGTATTGCCGATTACTGGTAc  <  1:646929/71‑1 (MQ=255) |                                                                       GGGAGTCGGTGTTGCCTTCTAACGTTGCGGCTCGCGTGGCGGTGGAAGCAGGTATTGCCGATTACTGGTAC  >  minE/1627690‑1627760

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑