Missing coverage evidence...
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AATGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCA  >  minE/1662820‑1662890 |                                                                       aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAATGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:37087/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:53868/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:39328/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:398710/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:430261/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:438302/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:459874/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:469809/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:486766/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:519007/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:533958/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:387185/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:544851/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:573691/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:578727/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:598653/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:599242/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:60881/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:637754/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:639463/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:650757/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:302127/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:123236/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:147/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:190993/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:206912/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:216412/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:226295/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:28169/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:29136/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:297453/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:113123/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:304560/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:321594/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:332137/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:332157/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:352156/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:369298/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:37394/71‑1 (MQ=255) aaTGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCa  <  1:386755/71‑1 (MQ=255) |                                                                       AATGATAAAACCTTAGTGGAAGGTGTTTCTTTAACCTATAAGGAAGGCACCAAAGTGTATACCTCTACCCA  >  minE/1662820‑1662890

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑