Missing coverage evidence...
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CCCGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGT  >  minE/1685233‑1685303 |                                                                       cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:536704/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:101258/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:45482/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:463202/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:476981/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:483698/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:486269/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:502900/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:506426/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:511144/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:511157/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:428522/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:55046/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:553450/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:554662/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:556473/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:557052/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:57835/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:59769/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:624748/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:74000/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:89251/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:27651/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:113920/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:124684/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:126519/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:157690/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:160932/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:177429/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:226743/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:230547/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:257924/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:275642/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:411314/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:276535/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:302356/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:323731/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:338960/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:34135/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:344366/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:360708/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:374657/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:399988/71‑1 (MQ=255) cccGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGGCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:465570/71‑1 (MQ=255) cccAGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGt  <  1:556994/71‑1 (MQ=255) |                                                                       CCCGGAAATTCAGATTATCGATGCCCGCATGGCGTCGCCTGGACAGGAGGATCGTAACGTTGCTCAGGAGT  >  minE/1685233‑1685303

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑