Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1701099	1701154	56	27 [0]	[0] 13	hcaR	DNA‑binding transcriptional regulator

CCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACTCACCAGCTCAATCAA  >  minE/1701155‑1701225 |                                                                       ccGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACTCACCAGCtcaatcaa  <  1:196850/71‑1 (MQ=255) ccGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACTCACCAGCtcaatcaa  <  1:285640/71‑1 (MQ=255) ccGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACTCACCAGCtcaatcaa  <  1:306714/71‑1 (MQ=255) ccGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACTCACCAGCtcaatcaa  <  1:405513/71‑1 (MQ=255) ccGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACTCACCAGCtcaatcaa  <  1:41299/71‑1 (MQ=255) ccGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACTCACCAGCtcaatcaa  <  1:464750/71‑1 (MQ=255) ccGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACTCACCAGCtcaatcaa  <  1:473012/71‑1 (MQ=255) ccGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACTCACCAGCtcaatcaa  <  1:505334/71‑1 (MQ=255) ccGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACTCACCAGCtcaatcaa  <  1:557722/71‑1 (MQ=255) ccGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACTCACCAGCtcaatcaa  <  1:563239/71‑1 (MQ=255) ccGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACTCACCAGCtcaatcaa  <  1:59079/71‑1 (MQ=255) ccGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACTCACCAGCtcaatcaa  <  1:629324/71‑1 (MQ=255) ccGACGTCGAGATCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACTCACCAGCtcaatcaa  <  1:440566/71‑1 (MQ=255) |                                                                       CCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAAACTCACCAGCTCAATCAA  >  minE/1701155‑1701225

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑