Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1701226	1701272	47	22 [0]	[0] 14	hcaR	DNA‑binding transcriptional regulator

AATTCACTTCCGCCGATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCG  >  minE/1701273‑1701342 |                                                                      aaTTCACTTCCGCCGATGGCACAAAGCCAATGGTTTATTGTCTGTCTTCCTGa                   >  1:226670/1‑53 (MQ=255) aaTTCACTTCCGCCGATGGCACAAAGCCAATGGTTAAttct                               >  1:629685/1‑39 (MQ=255) aaTTCACTTCCGCCGATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCg  >  1:156973/1‑70 (MQ=255) aaTTCACTTCCGCCGATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCg  >  1:227930/1‑70 (MQ=255) aaTTCACTTCCGCCGATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCg  >  1:277692/1‑70 (MQ=255) aaTTCACTTCCGCCGATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCg  >  1:2907/1‑70 (MQ=255) aaTTCACTTCCGCCGATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCg  >  1:306352/1‑70 (MQ=255) aaTTCACTTCCGCCGATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCg  >  1:311291/1‑70 (MQ=255) aaTTCACTTCCGCCGATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCg  >  1:347046/1‑70 (MQ=255) aaTTCACTTCCGCCGATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCg  >  1:49076/1‑70 (MQ=255) aaTTCACTTCCGCCGATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCg  >  1:550086/1‑70 (MQ=255) aaTTCACTTCCGCCGATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCg  >  1:635516/1‑70 (MQ=255) aaTTCACTTCCGCCGATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCg  >  1:72744/1‑70 (MQ=255) aaTTCACTTCCGCCGATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCg  >  1:88992/1‑70 (MQ=255) |                                                                      AATTCACTTCCGCCGATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCG  >  minE/1701273‑1701342

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑