Missing coverage evidence...
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AACAATATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCT  >  minE/1833792‑1833862 |                                                                       aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGa                    >  1:622284/1‑53 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTTTCt  >  1:597810/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATc   >  1:526630/1‑70 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:549269/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:434261/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:454761/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:461689/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:462713/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:463701/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:475103/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:482019/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:53194/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:538192/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:398984/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:575324/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:579931/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:587994/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:589567/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:634599/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:640449/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:88148/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:299329/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:153329/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:169687/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:184310/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:198714/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:207744/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:275242/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:282398/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:293829/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:131681/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:304937/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:321592/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:349424/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:353766/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:367035/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:369773/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:391587/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:39418/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:398204/1‑71 (MQ=255) aacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCCCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCt  >  1:21518/1‑71 (MQ=255) |                                                                       AACAATATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCT  >  minE/1833792‑1833862

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑