Missing coverage evidence...
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TTCCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTCGCG  >  minE/1858367‑1858436  |                                                                     ttcCGGTACACCGGCGATTATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgcg  <  1:266291/70‑1 (MQ=255)  tcCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgct  <  1:87829/69‑2 (MQ=255)  tcCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgcg  <  1:423380/69‑1 (MQ=255)  tcCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgcg  <  1:420994/69‑1 (MQ=255)  tcCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgcg  <  1:429680/69‑1 (MQ=255)  tcCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgcg  <  1:446351/69‑1 (MQ=255)  tcCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgcg  <  1:463271/69‑1 (MQ=255)  tcCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgcg  <  1:482914/69‑1 (MQ=255)  tcCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgcg  <  1:483679/69‑1 (MQ=255)  tcCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgcg  <  1:488611/69‑1 (MQ=255)  tcCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgcg  <  1:494836/69‑1 (MQ=255)  tcCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgcg  <  1:495111/69‑1 (MQ=255)  tcCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgcg  <  1:496992/69‑1 (MQ=255)  tcCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgcg  <  1:518330/69‑1 (MQ=255)  tcCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgcg  <  1:528808/69‑1 (MQ=255)  tcCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgcg  <  1:539615/69‑1 (MQ=255)  tcCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgcg  <  1:572581/69‑1 (MQ=255)  tcCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgcg  <  1:5833/69‑1 (MQ=255)  tcCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgcg  <  1:586914/69‑1 (MQ=255)  tcCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgcg  <  1:24652/69‑1 (MQ=255)  tcCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgcg  <  1:113754/69‑1 (MQ=255)  tcCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgcg  <  1:118826/69‑1 (MQ=255)  tcCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgcg  <  1:151314/69‑1 (MQ=255)  tcCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgcg  <  1:177189/69‑1 (MQ=255)  tcCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgcg  <  1:190657/69‑1 (MQ=255)  tcCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgcg  <  1:228745/69‑1 (MQ=255)  tcCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgcg  <  1:229088/69‑1 (MQ=255)  tcCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgcg  <  1:240059/69‑1 (MQ=255)  tcCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgcg  <  1:101477/69‑1 (MQ=255)  tcCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgcg  <  1:277060/69‑1 (MQ=255)  tcCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgcg  <  1:281136/69‑1 (MQ=255)  tcCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgcg  <  1:308098/69‑1 (MQ=255)  tcCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgcg  <  1:351867/69‑1 (MQ=255)  tcCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgcg  <  1:41557/69‑1 (MQ=255)  tcCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgcg  <  1:419711/69‑1 (MQ=255)  tcCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGATCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTcgcg  <  1:351760/69‑1 (MQ=255)  |                                                                     TTCCGGTACACCGGCGATGATCAGATTCTGGTTCGCCGTAATGCGGAAATCGCCTTTGTGGATCTTCGCG  >  minE/1858367‑1858436

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑