Missing coverage evidence...
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CCGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTG  >  minE/1870312‑1870381 |                                                                      ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:491734/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:320361/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:330144/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:346750/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:348078/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:397309/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:403304/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:437167/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:442319/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:449647/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:301758/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:5189/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:582692/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:617629/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:62212/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:642630/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:648249/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:71243/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:9651/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:221932/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:109489/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:118481/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:146855/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:147819/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:155197/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:180256/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:182685/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:186669/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:195325/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:105550/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:23969/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:241006/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:252585/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:2669/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:278193/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:283434/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:291120/70‑1 (MQ=255) ccGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTg  <  1:294855/70‑1 (MQ=255) |                                                                      CCGCGATGATCATTACCGGATTACTGGGTCTGTTAATGGCAACGTATCCACCGCTGTGGGTAATGCTCTG  >  minE/1870312‑1870381

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑