Missing coverage evidence...
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ACGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCCCAGGTC  >  minE/1878867‑1878935 |                                                                     aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAAt                          >  1:52577/1‑45 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTGGTGCCccaggt   >  1:85547/1‑68 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGccc        >  1:603274/1‑63 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:557706/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:109172/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:433222/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:452729/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:471337/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:48770/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:507655/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:518962/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:550033/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:556893/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:40886/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:565822/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:602462/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:651631/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:653029/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:653213/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:77886/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:80286/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:9008/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:236535/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:122494/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:141295/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:14385/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:158017/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:163292/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:175456/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:177771/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:204084/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:208842/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:24763/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:252397/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:260065/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:30536/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:308576/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:322890/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:342700/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:34918/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:37283/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggt   >  1:389156/1‑68 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggt   >  1:576473/1‑68 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggt   >  1:154469/1‑68 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggt   >  1:438320/1‑68 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTAGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:56651/1‑69 (MQ=255) aCGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTGTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCccaggtc  >  1:364076/1‑69 (MQ=255) |                                                                     ACGACCCGTGGTGAAGTTGTTGCGGCGGCTCATTTTGGTACGAATGAAACGCTCGTAGTGCCCCAGGTC  >  minE/1878867‑1878935

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑