Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1960261	1960319	59	3 [0]	[0] 52	[pgk]	[pgk]

CAGGCAGTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGT  >  minE/1960320‑1960388 |                                                                     caggctgTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:119406/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTGGGAGATTTTGt  <  1:539594/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGTAGATTTTGt  <  1:548604/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:500963/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:374589/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:407121/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:417118/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:430529/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:433305/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:462207/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:46582/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:480257/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:483876/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:488575/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:490834/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:492276/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:496476/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:368918/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:522309/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:530892/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:539714/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:593532/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:600212/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:602947/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:625673/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:632694/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:656657/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:24498/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:11655/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:150565/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:153363/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:162355/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:180501/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:198338/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:202416/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:219330/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:221604/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:22261/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:225833/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:241244/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:112699/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:252865/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:261149/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:261763/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:268122/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:271988/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:272144/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:27412/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:286518/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:297745/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:305684/69‑1 (MQ=255) caggcagTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGt  <  1:357280/69‑1 (MQ=255) |                                                                     CAGGCAGTACTTTACCTTCCACGAATTCGAGGAATGCGCCGCCGCCAGTGGAGATGTAGGAGATTTTGT  >  minE/1960320‑1960388

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑