Missing coverage evidence...
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TCCGGCAAAAAAACCGCCCGCACAATAACATCATTCTTCCTGATCACGTTTCACCGCAGATTATCATCACA  >  minE/1974926‑1974996 |                                                                       tCCGGCAAAAAAACCGCCCGCACAATAACATCATTCTTCCTGATCACGTTTCACCGCAGATTATCATcaca  <  1:56517/71‑1 (MQ=255) tCCGGCAAAAAAACCGCCCGCACAATAACATCATTCTTCCTGATCACGTTTCACCGCAGATTATCATcaca  <  1:97620/71‑1 (MQ=255) tCCGGCAAAAAAACCGCCCGCACAATAACATCATTCTTCCTGATCACGTTTCACCGCAGATTATCATcaca  <  1:93547/71‑1 (MQ=255) tCCGGCAAAAAAACCGCCCGCACAATAACATCATTCTTCCTGATCACGTTTCACCGCAGATTATCATcaca  <  1:89014/71‑1 (MQ=255) tCCGGCAAAAAAACCGCCCGCACAATAACATCATTCTTCCTGATCACGTTTCACCGCAGATTATCATcaca  <  1:660328/71‑1 (MQ=255) tCCGGCAAAAAAACCGCCCGCACAATAACATCATTCTTCCTGATCACGTTTCACCGCAGATTATCATcaca  <  1:657393/71‑1 (MQ=255) tCCGGCAAAAAAACCGCCCGCACAATAACATCATTCTTCCTGATCACGTTTCACCGCAGATTATCATcaca  <  1:653833/71‑1 (MQ=255) tCCGGCAAAAAAACCGCCCGCACAATAACATCATTCTTCCTGATCACGTTTCACCGCAGATTATCATcaca  <  1:653523/71‑1 (MQ=255) tCCGGCAAAAAAACCGCCCGCACAATAACATCATTCTTCCTGATCACGTTTCACCGCAGATTATCATcaca  <  1:630012/71‑1 (MQ=255) tCCGGCAAAAAAACCGCCCGCACAATAACATCATTCTTCCTGATCACGTTTCACCGCAGATTATCATcaca  <  1:62653/71‑1 (MQ=255) tCCGGCAAAAAAACCGCCCGCACAATAACATCATTCTTCCTGATCACGTTTCACCGCAGATTATCATcaca  <  1:608564/71‑1 (MQ=255) tCCGGCAAAAAAACCGCCCGCACAATAACATCATTCTTCCTGATCACGTTTCACCGCAGATTATCATcaca  <  1:596197/71‑1 (MQ=255) tCCGGCAAAAAAACCGCCCGCACAATAACATCATTCTTCCTGATCACGTTTCACCGCAGATTATCATcaca  <  1:176301/71‑1 (MQ=255) tCCGGCAAAAAAACCGCCCGCACAATAACATCATTCTTCCTGATCACGTTTCACCGCAGATTATCATcaca  <  1:546536/71‑1 (MQ=255) tCCGGCAAAAAAACCGCCCGCACAATAACATCATTCTTCCTGATCACGTTTCACCGCAGATTATCATcaca  <  1:515685/71‑1 (MQ=255) tCCGGCAAAAAAACCGCCCGCACAATAACATCATTCTTCCTGATCACGTTTCACCGCAGATTATCATcaca  <  1:514111/71‑1 (MQ=255) tCCGGCAAAAAAACCGCCCGCACAATAACATCATTCTTCCTGATCACGTTTCACCGCAGATTATCATcaca  <  1:457528/71‑1 (MQ=255) tCCGGCAAAAAAACCGCCCGCACAATAACATCATTCTTCCTGATCACGTTTCACCGCAGATTATCATcaca  <  1:355467/71‑1 (MQ=255) tCCGGCAAAAAAACCGCCCGCACAATAACATCATTCTTCCTGATCACGTTTCACCGCAGATTATCATcaca  <  1:335846/71‑1 (MQ=255) tCCGGCAAAAAAACCGCCCGCACAATAACATCATTCTTCCTGATCACGTTTCACCGCAGATTATCATcaca  <  1:331102/71‑1 (MQ=255) tCCGGCAAAAAAACCGCCCGCACAATAACATCATTCTTCCTGATCACGTTTCACCGCAGATTATCATcaca  <  1:221439/71‑1 (MQ=255) tCCGGCAAAAAAACCGCCCGCACAATAACATCATTCTTCCTGATCACGTTTCACCGCAGATTATCATcaca  <  1:218012/71‑1 (MQ=255) tCCGGCAAAAAAACCGCCCGCACAATAACATCATTCTTCCTGATCACGTTTCACCGCAGATTATCATcaca  <  1:188461/71‑1 (MQ=255) tCCGGCAAAAAAACCGCCCGCACAATAACATCATTCTTCCTGATCACGTTTCACCGCAGATTATCATcaca  <  1:184500/71‑1 (MQ=255) tCCGGCAAAAAAACCGCCCGCACAATAACATCATTCTCCCTGATCACGTTTCACCGCAGATTATCATcaca  <  1:89349/71‑1 (MQ=255) |                                                                       TCCGGCAAAAAAACCGCCCGCACAATAACATCATTCTTCCTGATCACGTTTCACCGCAGATTATCATCACA  >  minE/1974926‑1974996

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑