Missing coverage evidence...
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CCCGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCA  >  minE/1981501‑1981569 |                                                                     ccccCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:477667/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATTCTAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:121749/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:516216/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:400988/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:401998/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:421435/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:43457/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:441438/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:452219/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:465044/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:494062/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:382209/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:531867/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:551338/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:591564/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:60012/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:606723/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:612186/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:645250/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:304538/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:119218/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:16660/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:171412/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:204876/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:206820/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:24126/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:243369/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:302569/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:383362/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:310721/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:318969/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:360423/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:362107/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:363726/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:366617/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:372698/69‑1 (MQ=255) cccGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCa  <  1:102402/69‑1 (MQ=255) |                                                                     CCCGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCA  >  minE/1981501‑1981569

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑