Missing coverage evidence...
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GGTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAG  >  minE/1982254‑1982323 |                                                                      ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGTGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:42843/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATATAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:227521/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:54712/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:437957/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:4530/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:453655/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:460846/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:464947/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:504349/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:51985/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:525223/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:541728/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:542524/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:415496/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:547513/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:559000/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:577223/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:585126/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:587616/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:621094/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:634904/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:65675/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:91389/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:283776/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:112085/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:123526/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:127634/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:139888/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:159126/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:163192/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:213833/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:216407/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:242260/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:266582/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:42636/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:285020/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:287005/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:296956/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:309771/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:328432/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:329310/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:349314/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:384601/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:388542/70‑1 (MQ=255) ggTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAg  <  1:101997/70‑1 (MQ=255) |                                                                      GGTGAAAACTACGTTCAGGAAGGGGTAGATAAAATTCGCCACTTTCAGGAACTGGGCGTAACAGGATTAG  >  minE/1982254‑1982323

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑