Missing coverage evidence...
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TACTTGTTATAAACGCTCGGCAACACCTCAACCAGCGGCGAGTCATCCTCAATATGCTGTTCAAATTGCGC  >  minE/1994426‑1994496 |                                                                       tACTTGTTATAAACGCTCGGCACCACCTCAACCAGCGGCGAGTCATCCTCAATATGCTGTTCAAAt       >  1:338512/1‑66 (MQ=255) tACTTGTTATAAACGCTCGGCAACACCTCAACCAGCGGCGTGTCATCCTCAATATGCt               >  1:255905/1‑58 (MQ=255) tACTTGTTATAAACGCTCGGCAACACCTCAACCAGCGGCGAGTCATCCTCAATATGCTGTTCAAATTgcgc  >  1:578222/1‑71 (MQ=255) tACTTGTTATAAACGCTCGGCAACACCTCAACCAGCGGCGAGTCATCCTCAATATGCTGTTCAAATTgcgc  >  1:427928/1‑71 (MQ=255) tACTTGTTATAAACGCTCGGCAACACCTCAACCAGCGGCGAGTCATCCTCAATATGCTGTTCAAATTgcgc  >  1:475342/1‑71 (MQ=255) tACTTGTTATAAACGCTCGGCAACACCTCAACCAGCGGCGAGTCATCCTCAATATGCTGTTCAAATTgcgc  >  1:491801/1‑71 (MQ=255) tACTTGTTATAAACGCTCGGCAACACCTCAACCAGCGGCGAGTCATCCTCAATATGCTGTTCAAATTgcgc  >  1:510492/1‑71 (MQ=255) tACTTGTTATAAACGCTCGGCAACACCTCAACCAGCGGCGAGTCATCCTCAATATGCTGTTCAAATTgcgc  >  1:52500/1‑71 (MQ=255) tACTTGTTATAAACGCTCGGCAACACCTCAACCAGCGGCGAGTCATCCTCAATATGCTGTTCAAATTgcgc  >  1:539139/1‑71 (MQ=255) tACTTGTTATAAACGCTCGGCAACACCTCAACCAGCGGCGAGTCATCCTCAATATGCTGTTCAAATTgcgc  >  1:577763/1‑71 (MQ=255) tACTTGTTATAAACGCTCGGCAACACCTCAACCAGCGGCGAGTCATCCTCAATATGCTGTTCAAATTgcgc  >  1:41703/1‑71 (MQ=255) tACTTGTTATAAACGCTCGGCAACACCTCAACCAGCGGCGAGTCATCCTCAATATGCTGTTCAAATTgcgc  >  1:589545/1‑71 (MQ=255) tACTTGTTATAAACGCTCGGCAACACCTCAACCAGCGGCGAGTCATCCTCAATATGCTGTTCAAATTgcgc  >  1:600226/1‑71 (MQ=255) tACTTGTTATAAACGCTCGGCAACACCTCAACCAGCGGCGAGTCATCCTCAATATGCTGTTCAAATTgcgc  >  1:600410/1‑71 (MQ=255) tACTTGTTATAAACGCTCGGCAACACCTCAACCAGCGGCGAGTCATCCTCAATATGCTGTTCAAATTgcgc  >  1:606664/1‑71 (MQ=255) tACTTGTTATAAACGCTCGGCAACACCTCAACCAGCGGCGAGTCATCCTCAATATGCTGTTCAAATTgcgc  >  1:654105/1‑71 (MQ=255) tACTTGTTATAAACGCTCGGCAACACCTCAACCAGCGGCGAGTCATCCTCAATATGCTGTTCAAATTgcgc  >  1:68859/1‑71 (MQ=255) tACTTGTTATAAACGCTCGGCAACACCTCAACCAGCGGCGAGTCATCCTCAATATGCTGTTCAAATTgcgc  >  1:75026/1‑71 (MQ=255) tACTTGTTATAAACGCTCGGCAACACCTCAACCAGCGGCGAGTCATCCTCAATATGCTGTTCAAATTgcgc  >  1:41863/1‑71 (MQ=255) tACTTGTTATAAACGCTCGGCAACACCTCAACCAGCGGCGAGTCATCCTCAATATGCTGTTCAAATTgcgc  >  1:121894/1‑71 (MQ=255) tACTTGTTATAAACGCTCGGCAACACCTCAACCAGCGGCGAGTCATCCTCAATATGCTGTTCAAATTgcgc  >  1:412356/1‑71 (MQ=255) tACTTGTTATAAACGCTCGGCAACACCTCAACCAGCGGCGAGTCATCCTCAATATGCTGTTCAAATTgcgc  >  1:398796/1‑71 (MQ=255) tACTTGTTATAAACGCTCGGCAACACCTCAACCAGCGGCGAGTCATCCTCAATATGCTGTTCAAATTgcgc  >  1:378479/1‑71 (MQ=255) tACTTGTTATAAACGCTCGGCAACACCTCAACCAGCGGCGAGTCATCCTCAATATGCTGTTCAAATTgcgc  >  1:375506/1‑71 (MQ=255) tACTTGTTATAAACGCTCGGCAACACCTCAACCAGCGGCGAGTCATCCTCAATATGCTGTTCAAATTgcgc  >  1:340599/1‑71 (MQ=255) tACTTGTTATAAACGCTCGGCAACACCTCAACCAGCGGCGAGTCATCCTCAATATGCTGTTCAAATTgcgc  >  1:28441/1‑71 (MQ=255) tACTTGTTATAAACGCTCGGCAACACCTCAACCAGCGGCGAGTCATCCTCAATATGCTGTTCAAATTgcgc  >  1:263654/1‑71 (MQ=255) tACTTGTTATAAACGCTCGGCAACACCTCAACCAGCGGCGAGTCATCCTCAATATGCTGTTCAAATTgcgc  >  1:262096/1‑71 (MQ=255) tACTTGTTATAAACGCTCGGCAACACCTCAACCAGCGGCGAGTCATCCTCAATATGCTGTTCAAATTgcgc  >  1:252748/1‑71 (MQ=255) tACTTGTTATAAACGCTCGGCAACACCTCAACCAGCGGCGAGTCATCCTCAATATGCTGTTCAAATTgcgc  >  1:221227/1‑71 (MQ=255) tACTTGTTATAAACGCTCGGCAACACCTCAACCAGCGGCGAGTCATCCTCAATATGCTGTTCAAATTgcgc  >  1:172246/1‑71 (MQ=255) tACTTGTTATAAACGCTCGGCAACACCTCAACCAGCGGCGAGTCATCCTCAATATGCTGTTCAAATTgcgc  >  1:164726/1‑71 (MQ=255) tACTTGTTATAAACGCTCGGCAACACCTCAACCAGCGGCGAGTCATCCTCAATATGCTGTTCAAATTgcgc  >  1:150919/1‑71 (MQ=255) tACTTGTTATAAACGCTCGGCAACACATCAACCAGCGGCGAGTCATCCTCAATATGCTGTTCAAATTgcgc  >  1:179732/1‑71 (MQ=255) |                                                                       TACTTGTTATAAACGCTCGGCAACACCTCAACCAGCGGCGAGTCATCCTCAATATGCTGTTCAAATTGCGC  >  minE/1994426‑1994496

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑