Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2042543	2042597	55	10 [0]	[0] 36	glgS	predicted glycogen synthesis protein

CAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGT  >  minE/2042598‑2042668 |                                                                       cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCggc  <  1:196271/71‑2 (MQ=255) cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGt  <  1:616766/71‑1 (MQ=255) cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGt  <  1:457869/71‑1 (MQ=255) cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGt  <  1:457930/71‑1 (MQ=255) cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGt  <  1:481203/71‑1 (MQ=255) cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGt  <  1:515660/71‑1 (MQ=255) cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGt  <  1:525483/71‑1 (MQ=255) cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGt  <  1:5490/71‑1 (MQ=255) cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGt  <  1:55670/71‑1 (MQ=255) cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGt  <  1:564275/71‑1 (MQ=255) cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGt  <  1:613868/71‑1 (MQ=255) cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGt  <  1:451300/71‑1 (MQ=255) cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGt  <  1:621654/71‑1 (MQ=255) cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGt  <  1:62447/71‑1 (MQ=255) cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGt  <  1:635752/71‑1 (MQ=255) cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGt  <  1:643339/71‑1 (MQ=255) cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGt  <  1:649520/71‑1 (MQ=255) cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGt  <  1:67396/71‑1 (MQ=255) cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGt  <  1:88525/71‑1 (MQ=255) cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGt  <  1:297966/71‑1 (MQ=255) cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGt  <  1:137289/71‑1 (MQ=255) cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGt  <  1:154409/71‑1 (MQ=255) cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGt  <  1:162575/71‑1 (MQ=255) cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGt  <  1:196377/71‑1 (MQ=255) cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGt  <  1:235766/71‑1 (MQ=255) cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGt  <  1:248342/71‑1 (MQ=255) cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGt  <  1:257706/71‑1 (MQ=255) cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGt  <  1:267793/71‑1 (MQ=255) cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGt  <  1:120794/71‑1 (MQ=255) cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGt  <  1:308800/71‑1 (MQ=255) cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGt  <  1:348451/71‑1 (MQ=255) cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGt  <  1:348734/71‑1 (MQ=255) cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGt  <  1:356295/71‑1 (MQ=255) cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGt  <  1:375018/71‑1 (MQ=255) cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGt  <  1:376092/71‑1 (MQ=255) cAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGt  <  1:387419/71‑1 (MQ=255) |                                                                       CAAAACTACGCGCCAGGAAATCGAAATTATTTAAAGAATTAAGACTATGATCCATAAGCACATCCTCCGGT  >  minE/2042598‑2042668

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑