Missing coverage evidence...
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TTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTT  >  minE/2083083‑2083153 |                                                                       ttCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGTCGTGtt  <  1:480/71‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGtt  <  1:538909/71‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGtt  <  1:427665/71‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGtt  <  1:438176/71‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGtt  <  1:445273/71‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGtt  <  1:456445/71‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGtt  <  1:466044/71‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGtt  <  1:47700/71‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGtt  <  1:536519/71‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGtt  <  1:418689/71‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGtt  <  1:544512/71‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGtt  <  1:565362/71‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGtt  <  1:578672/71‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGtt  <  1:598322/71‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGtt  <  1:616998/71‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGtt  <  1:631303/71‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGtt  <  1:633097/71‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGtt  <  1:70518/71‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGtt  <  1:2681/71‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGtt  <  1:171148/71‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGtt  <  1:18217/71‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGtt  <  1:191347/71‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGtt  <  1:192336/71‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGtt  <  1:210211/71‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGtt  <  1:238829/71‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGtt  <  1:2639/71‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGtt  <  1:13567/71‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGtt  <  1:286765/71‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGtt  <  1:290166/71‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGtt  <  1:292085/71‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGtt  <  1:311907/71‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGtt  <  1:32093/71‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGtt  <  1:347678/71‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACGGGTATTGGTCGGCGTGtt  <  1:32652/71‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAAACGGCTTGCTGCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGtt  <  1:266520/71‑1 (MQ=255) |                                                                       TTCCTTGAAAACGGCTTGCTTCCGGCGGCCTTTTTACCGGGCGACAGTTTACTGGTATTGGTCGGCGTGTT  >  minE/2083083‑2083153

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑