Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2106331	2106562	232	46 [1]	[0] 59	agaA	predicted truncated N‑acetylgalactosamine‑6‑phosphate deacetylase

CATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCA  >  minE/2106563‑2106632 |                                                                      catATGGCGTCGCTGCGTCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAACCCGGGCa  >  1:363423/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGAt                              >  1:454331/1‑42 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATg                             >  1:205975/1‑43 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGc   >  1:596666/1‑69 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:544824/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:579335/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:525143/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:494482/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:488034/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:48515/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:47197/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:427317/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:42631/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:424977/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:408263/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:400427/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:390447/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:575499/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:387022/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:586422/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:591575/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:598176/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:599380/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:616024/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:625545/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:642691/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:647066/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:661191/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:70672/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:8544/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:94365/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:263941/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:109917/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:110958/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:118821/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:120883/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:124424/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:142241/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:165476/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:184044/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:193470/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:237564/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:253722/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:257459/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:262875/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:387252/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:283426/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:291144/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:302624/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:317546/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:318712/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:327044/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:336264/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:336414/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:341395/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:356236/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:357544/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:360092/1‑70 (MQ=255) catATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCa  >  1:105155/1‑70 (MQ=255) |                                                                      CATATGGCGTCGCTGCATCCGGCGCGAATGCTGGGTGTTGATGGTGTTCTGGGATCGCTTAAACCGGGCA  >  minE/2106563‑2106632

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑