Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2137090	2137334	245	12 [0]	[0] 44	truB	tRNA pseudouridine synthase

TAAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAT  >  minE/2137335‑2137404 |                                                                      taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGc                             >  1:527415/1‑43 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAAGAGCAATTCAt  >  1:608680/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCa   >  1:207720/1‑69 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:541641/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:115334/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:457947/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:46162/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:473637/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:492810/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:495978/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:511880/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:53991/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:54043/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:454164/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:557797/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:574811/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:578384/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:614261/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:629333/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:6350/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:648652/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:91728/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:342720/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:117783/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:137765/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:141302/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:212479/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:290312/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:312753/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:319953/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:321526/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:453523/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:356678/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:364707/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:368695/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:381794/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:383809/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:384153/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:400832/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:416407/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:423749/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:424191/1‑70 (MQ=255) taAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAACAAACAGCAATTCAt  >  1:602454/1‑70 (MQ=255) taAGTGACTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAt  >  1:84762/1‑70 (MQ=255) |                                                                      TAAGTGCCTTTTGAGCAGTGAATTTCCAGCTCCAGCTCATTGCCTTCATGGCGAATAAACAGCAATTCAT  >  minE/2137335‑2137404

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑